RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366170.6

VSTM1-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1-202ENST00000366170 TTC38Q5R3I4 469 aa14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 GPR142Q7Z601 462 aa14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 USP28Q96RU2 1077 aa14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VSTM1-202ENST00000366170 B4DLN1 442 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SREBF1P36956 1147 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 UBXN2AP68543 259 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ARHGAP4P98171 946 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CNTN2Q02246 1040 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SP3Q02447 781 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ANO1Q5XXA6 986 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 DPP9Q86TI2 863 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 JMYQ8N9B5 988 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 DNERQ8NFT8 737 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PXMP2Q9NR77 195 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CLIC4Q9Y696 253 aa14.77□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PGK2P07205 417 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CYP3A4P08684 503 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MCM7P33993 719 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 NBR1Q14596 966 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 STK38Q15208 465 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 IWS1Q96ST2 819 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.76□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MARCH6O60337 910 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 NR3C2P08235 984 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ADORA2AP29274 412 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CCND2P30279 289 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PSMC4P43686 418 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 FCGRTP55899 365 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SPATA32Q96LK8 384 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.75□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 GPR25O00155 361 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 FIBPO43427 364 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 COBLO75128 1261 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 BMP15O95972 392 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 GRB14Q14449 540 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PGM5Q15124 567 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.74□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 RPTORQ8N122 1335 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 EDIL3O43854 480 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 TDP2O95551 362 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 YEATS4O95619 227 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CYP3A7P24462 503 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CIITAP33076 1130 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PDE4DQ08499 809 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MAP2K5Q13163 448 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PTGDRQ13258 359 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SLC39A14Q15043 492 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ARHGEF6Q15052 776 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 STXBP2Q15833 593 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 TNS4Q8IZW8 715 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms