RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 SPATA33Q96N06 139 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CAVIN2O95810 425 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT5P13647 590 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RFX1P22670 979 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TYRO3Q06418 890 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PKP1Q13835 747 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 IWS1Q96ST2 819 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PTGS1P23219 599 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 POSTNQ15063 836 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NACC1Q96RE7 527 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PARP2Q9UGN5 583 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PDHXO00330 501 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A27O95847 323 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ALDH1A1P00352 501 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CD19P15391 556 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 UBXN1Q04323 297 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NBPF11Q86T75 865 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MTA3Q9BTC8 594 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CEP83Q9Y592 693 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SHTN1A0MZ66 631 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SOCS7O14512 581 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PFKFB1P16118 471 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CTNNA2P26232 953 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC8A3P57103 927 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP2R5AQ15172 486 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GJA10Q969M2 543 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 EFCC1Q9HA90 598 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NFKBIEO00221 500 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BRD1O95696 1058 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP2C8P10632 490 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GNASQ5JWF2 1037 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NEK11Q8NG66 645 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CSRNP2Q9H175 543 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM17Q9Y577 477 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 MRC1P22897 1456 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 KBTBD13C9JR72 458 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NR3C2P08235 984 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GNAT1P11488 350 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VCAM1P19320 739 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VGLL4Q14135 290 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 ADALQ6DHV7 355 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VPS16Q9H269 839 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PANK4Q9NVE7 773 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BARHL2Q9NY43 387 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR64B1ANS9 1081 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GGPS1O95749 300 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP1R2P41236 205 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 OSTNP61366 133 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 RGMBQ6NW40 437 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NACA2Q9H009 215 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms