RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 SPATA33Q96N06 139 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CAVIN2O95810 425 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT5P13647 590 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RFX1P22670 979 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TYRO3Q06418 890 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PKP1Q13835 747 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 IWS1Q96ST2 819 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PTGS1P23219 599 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 POSTNQ15063 836 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NACC1Q96RE7 527 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PARP2Q9UGN5 583 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PDHXO00330 501 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A27O95847 323 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ALDH1A1P00352 501 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CD19P15391 556 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 UBXN1Q04323 297 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NBPF11Q86T75 865 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MTA3Q9BTC8 594 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CEP83Q9Y592 693 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SHTN1A0MZ66 631 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SOCS7O14512 581 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PFKFB1P16118 471 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CTNNA2P26232 953 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC8A3P57103 927 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP2R5AQ15172 486 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GJA10Q969M2 543 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 EFCC1Q9HA90 598 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NFKBIEO00221 500 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BRD1O95696 1058 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP2C8P10632 490 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GNASQ5JWF2 1037 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NEK11Q8NG66 645 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CSRNP2Q9H175 543 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM17Q9Y577 477 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 MRC1P22897 1456 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 KBTBD13C9JR72 458 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NR3C2P08235 984 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GNAT1P11488 350 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VCAM1P19320 739 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VGLL4Q14135 290 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 ADALQ6DHV7 355 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 VPS16Q9H269 839 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PANK4Q9NVE7 773 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BARHL2Q9NY43 387 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR64B1ANS9 1081 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 GGPS1O95749 300 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP1R2P41236 205 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 OSTNP61366 133 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 RGMBQ6NW40 437 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 NACA2Q9H009 215 aa7.82□□□□□ -1.16
LRRTM3-201ENST00000361320 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms