RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 CUEDC2Q9H467 287 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 DACH1Q9UI36 760 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 PLCG1P19174 1290 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 CUL4BQ13620 913 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 DLK2Q6UY11 383 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 CALML4Q96GE6 196 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 POTEMA6NI47 508 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 C19orf81C9J6K1 198 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 ZNF75DP51815 510 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 ADM5C9JUS6 153 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 CYP3A4P08684 503 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 CIITAP33076 1130 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 TPM4P67936 248 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 MYL5Q02045 173 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 GPR162Q16538 588 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 Q4G0T1 1027 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 LRRC15Q8TF66 581 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 GJA10Q969M2 543 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 HMGCS2P54868 508 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 PRR16Q569H4 304 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 KRT79Q5XKE5 535 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 C12orf42Q96LP6 360 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 FAM86B1E9PN63 330 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 MYL1P05976 194 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 CPXCR1Q8N123 301 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-201ENST00000331803 LENG9Q96B70 501 aa21.58■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.58■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 TBX3O15119 743 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ZBED4O75132 1171 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 FDX1P10109 184 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ZNF76P36508 570 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K9P80192 1104 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 GRB10Q13322 594 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 UIMC1Q96RL1 719 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 EPHX2P34913 555 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 PNMA5Q96PV4 448 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 RMND1Q9NWS8 449 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 VWA5AO00534 786 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 HSD17B4P51659 736 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 VGLL4Q14135 290 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 PNMA2Q9UL42 364 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 GLTPD2A6NH11 291 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ALAS1P13196 640 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SPC24Q8NBT2 197 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 FAM20AQ96MK3 541 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 STK17AQ9UEE5 414 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ESPNB1AK53 854 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 NFIBO00712 420 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ATG4CQ96DT6 458 aa21.55■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 AMPD3Q01432 767 aa21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 DRC7Q8IY82 874 aa21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 FANCLQ9NW38 375 aa21.54■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 MSH4O15457 936 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms