RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SRGAP2O75044 1071 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM58Q8NG06 486 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 RUBCNQ92622 972 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SPA17Q15506 151 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 MAN2A1Q16706 1144 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC42Q96M95 316 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PNMA5Q96PV4 448 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PIGSQ96S52 555 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PRLRP16471 622 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC63Q05C16 580 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 NFIXQ14938 502 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CEP95Q96GE4 821 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 NDST4Q9H3R1 872 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 JRKLQ9Y4A0 524 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 MYMKA6NI61 221 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 IDEP14735 1019 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 TEX11Q8IYF3 940 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC102AQ96A19 550 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SH2D4AQ9H788 454 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 SNX12Q9UMY4 172 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 EHHADHQ08426 723 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 PDIA5Q14554 519 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 CALCRLQ16602 461 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 COG1Q8WTW3 980 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD1-201ENST00000331462 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 IL1R1P14778 569 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 RHBDL3P58872 404 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CYP27A1Q02318 531 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 GAKO14976 1311 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 FOCADQ5VW36 1801 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 MMGT1Q8N4V1 131 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 RAB34Q9BZG1 259 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CD209Q9NNX6 404 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 TACC1O75410 805 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 TXKP42681 527 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PSMD2Q13200 908 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 SLC51AQ86UW1 340 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CAGE1Q8TC20 777 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 RAD54LQ92698 747 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 HPS3Q969F9 1004 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 EDIL3O43854 480 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 IVLP07476 585 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PDHBP11177 359 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CAPN2P17655 700 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 KIF11P52732 1056 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM260Q9NX78 707 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L5A8MUK1 530 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 EPHB6O15197 1021 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 SNHG28P0DPA3 235 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 ADCY7P51828 1080 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC96Q2M329 555 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 CREG2Q8IUH2 290 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PROM2Q8N271 834 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PJA2O43164 708 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD1-201ENST00000331462 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms