RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa17.8■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 A6NJR5 290 aa17.79■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 CYTH3O43739 400 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 ACRP10323 421 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 GHRHRQ02643 423 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 SKAP1Q86WV1 359 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 OR6J1Q8NGC5 347 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 SCFD2Q8WU76 684 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa17.79■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 HSD17B4P51659 736 aa17.78■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 GRM4Q14833 912 aa17.78■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 ZNF365Q70YC5 407 aa17.78■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 TRDNQ13061 729 aa17.77■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 TMEM199Q8N511 208 aa17.77■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 RMDN3Q96TC7 470 aa17.77■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 AMNQ9BXJ7 453 aa17.77■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CTSW-201ENST00000307886 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
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CTSW-201ENST00000307886 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 GRXCR1A8MXD5 290 aa17.76■□□□□ 0.43
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CTSW-201ENST00000307886 NCOA7Q8NI08 942 aa17.76■□□□□ 0.43
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CTSW-201ENST00000307886 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.75■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 B4DLN1 442 aa17.74■□□□□ 0.43
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CTSW-201ENST00000307886 PBX2P40425 430 aa17.74■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.74■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 AFG1LQ8WV93 481 aa17.74■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 HERVK_113Q902F9 699 aa17.74■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 CTAGE1Q96RT6 745 aa17.74■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 LY9Q9HBG7 655 aa17.74■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 KPNA6O60684 536 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
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CTSW-201ENST00000307886 TMEM67Q5HYA8 995 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 HOMER1Q86YM7 354 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 IL31RAQ8NI17 732 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 MYLIPQ8WY64 445 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 KAT2BQ92831 832 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 SCLYQ96I15 445 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 SCN5AQ14524 2016 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 VCANP13611 3396 aa17.73■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 MMP3P08254 477 aa17.72■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 NECTIN1Q15223 517 aa17.72■□□□□ 0.43
CTSW-201ENST00000307886 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.72■□□□□ 0.43
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