RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 EBAG9O00559 213 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 INPP5BP32019 993 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 ERVK-24P63145 666 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 ADSSL1Q8N142 457 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 LRRC15Q8TF66 581 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 CEP95Q96GE4 821 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 KLRC4O43908 158 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 SAMM50Q9Y512 469 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 GTF2IP78347 998 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 CDC23Q9UJX2 597 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 TRIM37O94972 964 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 HSPA1LP34931 641 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 KCNB1Q14721 858 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 H7C1D1 291 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 KIF5CO60282 957 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 NAPAP54920 295 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 INHBEP58166 350 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 MCM8Q9UJA3 840 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 LAD1O00515 517 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 PRPHP41219 470 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 CABS1Q96KC9 395 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 POTEB2H3BUK9 544 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 RIMBP2O15034 1052 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 UBA7P41226 1012 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 UBXN1Q04323 297 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 TRIM14Q14142 442 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 NEDD9Q14511 834 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 TMC4Q7Z404 712 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 SLC35F6Q8N357 371 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 MYL1P05976 194 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 IRAK1P51617 712 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 SP8Q8IXZ3 490 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 CEP112Q8N8E3 955 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
HPS6-201ENST00000299238 KRT9P35527 623 aa22.39■■□□□ 1.17
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HPS6-201ENST00000299238 CHP1Q99653 195 aa22.39■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 RHOBTB3O94955 611 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 NOVP48745 357 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 PICALMQ13492 652 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 COA1Q9GZY4 146 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 VEZTQ9HBM0 779 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 TFR2Q9UP52 801 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 F8W031 263 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 H0YHG0 523 aa22.37■■□□□ 1.17
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HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP25P42331 645 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 FNTAP49354 379 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 SMCO2A6NFE2 343 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 USP17L5A8MUK1 530 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 LGALS16A8MUM7 142 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 SEMA3FQ13275 785 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 PIGSQ96S52 555 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 C6orf50Q9HD87 102 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HPS6-201ENST00000299238 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
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