RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEDQ86YR6 584 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC37A4O43826 429 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2C8P10632 490 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIN1Q05586 938 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CALCRLQ16602 461 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 RESP18Q5W5W9 173 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO40Q9UH90 709 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GVL5 298 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP3A4P08684 503 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP3A7P24462 503 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FSTL1Q12841 308 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CSRNP2Q9H175 543 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 DACT1Q9NYF0 836 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 COL20A1Q9P218 1284 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 NR1I2O75469 434 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CNMDO75829 334 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC10A3P09131 477 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 COPB2P35606 906 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 PEX10O60683 326 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A27O95847 323 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 PFKFB1P16118 471 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 YY1P25490 414 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CIITAP33076 1130 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFA8P51970 172 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 MBOAT7Q96N66 472 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 RPTORQ8N122 1335 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF76P36508 570 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC102AQ96A19 550 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN18Q99952 460 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 IL17AQ16552 155 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SPECC1Q5M775 1068 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR9Q96QG7 549 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 PFASO15067 1338 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK-9P63128 1117 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK-24P63145 666 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 UBXN2AP68543 259 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 Q4G0T1 1027 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 HPSEQ9Y251 543 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM86B1E9PN63 330 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 KINO60870 393 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR16Q569H4 304 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 RMDN3Q96TC7 470 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCH6O60337 910 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ERCC3P19447 782 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 SYKP43405 635 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 TXKP42681 527 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PXMP2Q9NR77 195 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 INHBEP58166 350 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 CCNA1P78396 465 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 Q3C1V9 767 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-201ENST00000298838 LENG9Q96B70 501 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms