RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 RAB21Q9UL25 225 aa11.91□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 RNF40O75150 1001 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 GTF2IP78347 998 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 ADSSL1Q8N142 457 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC51Q96ER9 411 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 MTMR9Q96QG7 549 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 C6orf229H3BNL8 230 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 EDIL3O43854 480 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 INF2Q27J81 1249 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 BORCS6Q96GS4 357 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 MASTLQ96GX5 879 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 SLX4Q8IY92 1834 aa11.9□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 ZSCAN12O43309 604 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 CASP1P29466 404 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SHMT1P34896 483 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 CHMP4BP1P59074 171 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 POLD4Q9HCU8 107 aa11.9□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SMCO2A6NFE2 343 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 OR52Z1P0C646 297 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 HDXQ7Z353 690 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 NEK8Q86SG6 692 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 LRRC15Q8TF66 581 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 MKL1Q969V6 931 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 MIEF2Q96C03 454 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 USP17L5A8MUK1 530 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 H7C1D1 291 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 TPM1P09493 284 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 STAT6P42226 847 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PAK1Q13153 545 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PODNQ7Z5L7 613 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 TTLL1O95922 423 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PPP1R2P41236 205 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 FNTAP49354 379 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 NAPAP54920 295 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF543Q08ER8 600 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 BRD3Q15059 726 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SAMM50Q9Y512 469 aa11.89□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC26A4O43511 780 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 BIRC2Q13490 618 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 STYK1Q6J9G0 422 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC17Q96LX7 622 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PIGSQ96S52 555 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 IDI2Q9BXS1 227 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 TEX33O43247 280 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 AKR1B1P15121 316 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 HINFPQ9BQA5 517 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 TRIM14Q14142 442 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PDIA5Q14554 519 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 THAP9Q9H5L6 903 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.88□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PRCPP42785 496 aa11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 KRT31Q15323 416 aa11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 MCM8Q9UJA3 840 aa11.87□□□□□ -0.51
PKNOX2-201ENST00000298282 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms