RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297979.9

C9orf3-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf3, Length 2,820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-202ENST00000297979 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PLCG1P19174 1290 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CYP3A7P24462 503 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CUL4BQ13620 913 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PDIA5Q14554 519 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 WRNIP1Q96S55 665 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PLIN2Q99541 437 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SREBF1P36956 1147 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 HAS1Q92839 578 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CALML4Q96GE6 196 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MBOAT7Q96N66 472 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MARCH6O60337 910 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MYL1P05976 194 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 MTMR2Q13614 643 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 DRC7Q8IY82 874 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 RMND1Q9NWS8 449 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 ABCB11O95342 1321 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 TPM3P06753 285 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 USP14P54578 494 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PICK1Q9NRD5 415 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 POTEMA6NI47 508 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.163e-7■■□□□ 11.8
C9orf3-202ENST00000297979 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 LRRC15Q8TF66 581 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 WDR18Q9BV38 432 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 LDHDQ86WU2 507 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CFBP00751 764 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 POLR2MP0CAP2 368 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 KRT79Q5XKE5 535 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 ICAM1P05362 532 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 PTPRAP18433 802 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 VCAM1P19320 739 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 DGKZQ13574 1117 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SPP2Q13103 211 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 GRB10Q13322 594 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 Q4G0T1 1027 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 KLRG1Q96E93 195 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 FANCLQ9NW38 375 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 STK17AQ9UEE5 414 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf3-202ENST00000297979 CYP3A4P08684 503 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 CIITAP33076 1130 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 PRR16Q569H4 304 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 ARID3AQ99856 593 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 IFNKQ9P0W0 207 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 FZD1Q9UP38 647 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 TBX3O15119 743 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 ATP1A3P13637 1013 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 BACE1P56817 501 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 GJA10Q969M2 543 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 PNMA5Q96PV4 448 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF536O15090 1300 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 FLOT1O75955 427 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 FANCCQ00597 558 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 SEMA3FQ13275 785 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 KCNB1Q14721 858 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-202ENST00000297979 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms