RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SCFD2Q8WU76 684 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CD320Q9NPF0 282 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.34□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEB3A0JP26 581 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB11FIP3O75154 756 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 AMHP03971 560 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 APPP05067 770 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RASA1P20936 1047 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP4BP1P59074 171 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEBQ6S5H4 581 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GMCL1Q96IK5 515 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.33□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 EMSYQ7Z589 1322 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01553A4QN01 128 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A1P11836 297 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5JP18859 108 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 BANK1Q8NDB2 785 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK9Q8TD19 979 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 MORC4Q8TE76 937 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP95Q96GE4 821 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.32□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH4Q9Y623 1939 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NJR5 290 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 ICAM1P05362 532 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP85Q6P2H3 762 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 SESTD1Q86VW0 696 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf31Q8N865 590 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 DNERQ8NFT8 737 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 VWCEQ96DN2 955 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 HAUS7Q99871 368 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL11AQ9H165 835 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 STX8Q9UNK0 236 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 LCHNA4D1U4 455 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL10P02778 98 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 ZP2Q05996 745 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RBL2Q08999 1139 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GPATCH3Q96I76 525 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 YME1L1Q96TA2 773 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDND1Q9NY35 253 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN5AQ14524 2016 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 SIP14410 1827 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPY2A6NKD2 308 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 LGR5O75473 907 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF15O94989 841 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GH1P01241 217 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 MCCP23508 829 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CALML3P27482 149 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB103AP81534 67 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 TFAP4Q01664 338 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GPM6BQ13491 265 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKDQ16760 1214 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC96Q2M329 555 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 APPBP2Q92624 585 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.29□□□□□ -0.92
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