RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 SMARCE1Q969G3 411 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 CLIC4Q9Y696 253 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 GNA11P29992 359 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 FKBP1BP68106 108 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PPIL2Q13356 520 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM66O15016 1216 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 CAVIN2O95810 425 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 ADCY7P51828 1080 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 BECN2A8MW95 431 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 GJA5P36382 358 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2B-201ENST00000265339 STX1AQ16623 288 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CST9Q5W186 159 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.255e-12■■□□□ 13
UBE2B-201ENST00000265339 UNCXA6NJT0 531 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 MYO1CO00159 1063 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CXCL11O14625 94 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 TREML2Q5T2D2 321 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ANO1Q5XXA6 986 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN26Q16670 478 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF536O15090 1300 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 GPS2Q13227 327 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CUL5Q93034 780 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 WNK4Q96J92 1243 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2SQ16763 222 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 UBXN4Q92575 508 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ATG4CQ96DT6 458 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM260Q9NX78 707 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 WNT7AO00755 349 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L15C9J2P7 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L11C9JVI0 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L18D6R9N7 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L22D6RA61 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L19D6RCP7 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L20D6RJB6 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 OPLAHO14841 1288 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CTAGE5O15320 804 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ATP2B1P20020 1258 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L24Q0WX57 530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 KCND1Q9NSA2 647 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 KINO60870 393 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 YEATS4O95619 227 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ICAM1P05362 532 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 GYS2P54840 703 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 VWA5AO00534 786 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 KIF3CO14782 793 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 DSG3P32926 999 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ME1P48163 572 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 MOGSQ13724 837 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 COG2Q14746 738 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 STK38Q15208 465 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms