RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.5■□□□□ 0.23
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CASC3-201ENST00000264645 ZNF609O15014 1411 aa16.5■□□□□ 0.23
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CASC3-201ENST00000264645 SMCO2A6NFE2 343 aa16.48■□□□□ 0.23
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CASC3-201ENST00000264645 ADAM9Q13443 819 aa16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.48■□□□□ 0.23
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CASC3-201ENST00000264645 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.48■□□□□ 0.23
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CASC3-201ENST00000264645 RDH13Q8NBN7 331 aa16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.48■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 FAM107AO95990 144 aa16.47■□□□□ 0.23
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CASC3-201ENST00000264645 TRAPPC10P48553 1259 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 CNPY4Q8N129 248 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 CRB1P82279 1406 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.47■□□□□ 0.23
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CASC3-201ENST00000264645 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 FAM205CA6NFA0 338 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 PDE6CP51160 858 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 DISC1Q9NRI5 854 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 SNX24Q9Y343 169 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 SETSIPP0DME0 302 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 11.1
CASC3-201ENST00000264645 DRP2Q13474 957 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 TCIRG1Q13488 830 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 TMC4Q7Z404 712 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.47■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 UNC13BO14795 1591 aa16.46■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 PLCG1P19174 1290 aa16.46■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 BCAMP50895 628 aa16.46■□□□□ 0.23
CASC3-201ENST00000264645 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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