RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 PPM1EQ8WY54 764 aa16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 JAG2Q9Y219 1238 aa16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TECP42680 631 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 PPFIA1Q13136 1202 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 PSMB7Q99436 277 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 NDST4Q9H3R1 872 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 EHD2Q9NZN4 543 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.58■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CXCR5P32302 372 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 AMPD3Q01432 767 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 DEF6Q9H4E7 631 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MYH10P35580 1976 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.57■□□□□ 0.24
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SYP-201ENST00000263233 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 EHD4Q9H223 541 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CPVLQ9H3G5 476 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.57■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 LRRC53A6NM62 1247 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 NCK2O43639 380 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 AKR1B10O60218 316 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TSPY3P0CV98 308 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TSPY8P0CW00 308 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 GRIN2DO15399 1336 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CCT5P48643 541 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 EPHB4P54760 987 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 NAPAP54920 295 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MAN2A1Q16706 1144 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 STIM2Q9P246 746 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.56■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 PJA2O43164 708 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CPP00450 1065 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CCDC181Q5TID7 509 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 RRAGAQ7L523 313 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 NEK8Q86SG6 692 aa16.55■□□□□ 0.24
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SYP-201ENST00000263233 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 KLRF2D3W0D1 207 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MAGEA1P43355 309 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 NT5C2P49902 561 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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SYP-201ENST00000263233 GBP6Q6ZN66 633 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CALML4Q96GE6 196 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TLR10Q9BXR5 811 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 STX8Q9UNK0 236 aa16.55■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 SMCO2A6NFE2 343 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MYMKA6NI61 221 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 OPA1O60313 960 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
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SYP-201ENST00000263233 GRB10Q13322 594 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TTMPQ5BVD1 217 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 SV2BQ7L1I2 683 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 CAVIN3Q969G5 261 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 ARL8AQ96BM9 186 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 MTMR8Q96EF0 704 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 ABCB11O95342 1321 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 GNGT1P63211 74 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 ATP2B2Q01814 1243 aa16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SYP-201ENST00000263233 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.54■□□□□ 0.24
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