RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260810.9

TOPBP1-201, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOPBP1, Length 5,378 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-201ENST00000260810 KLK7P49862 253 aa6.61□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 MBTPS1Q14703 1052 aa6.61□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.61□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.61□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.61□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 I6L893 689 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 VWA5AO00534 786 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ATP2A1O14983 1001 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 PPIP5K2O43314 1243 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 PLA2G6O60733 806 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 SLITRK3O94933 977 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 STK4Q13043 487 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 NYAP2Q9P242 653 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 AMHR2Q16671 573 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ANO5Q75V66 913 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 EYA3Q99504 573 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 RGS22Q8NE09 1264 aa6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 BAG6P46379 1132 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 RCAN1P53805 252 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 KCNMA1Q12791 1236 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CCDC93Q567U6 631 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 STAMQ92783 540 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 POTEMA6NI47 508 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ALDH1B1P30837 517 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 PICALMQ13492 652 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 KCNN1Q92952 543 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 MSH4O15457 936 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 GJB1P08034 283 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CFHP08603 1231 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CYP2C8P10632 490 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 ARHGEF15O94989 841 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 FCER1AP12319 257 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CCL14Q16627 93 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 PALB2Q86YC2 1186 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 KSR1Q8IVT5 923 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 CDCA5Q96FF9 252 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.59□□□□□ -1.35
TOPBP1-201ENST00000260810 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.59□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 CCDC142Q17RM4 750 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 MEIS1O00470 390 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 ZNF213O14771 459 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 COG2Q14746 738 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 ATG4CQ96DT6 458 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 STK32BQ9NY57 414 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 PFKFB1P16118 471 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 LMNB1P20700 586 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 MORC3Q14149 939 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 MYMKA6NI61 221 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 C6orf229H3BNL8 230 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 TEX33O43247 280 aa6.58□□□□□ -1.36
TOPBP1-201ENST00000260810 MTMR2Q13614 643 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms