RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 A6NJR5 290 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 FOSL2P15408 326 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 PDE4AP27815 886 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 CCL23P55773 120 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 TRDNQ13061 729 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO11Q86XK2 927 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D5Q92609 795 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF576Q9H609 170 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.57■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 IWS1Q96ST2 819 aa24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.56■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 GRIN2CQ14957 1233 aa24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 COPS5Q92905 334 aa24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 PBX4Q9BYU1 374 aa24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 IL25Q9H293 177 aa24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 MYH6P13533 1939 aa24.55■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 SEC23AQ15436 765 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 STXBP2Q15833 593 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 RMDN3Q96TC7 470 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 AMNQ9BXJ7 453 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 KLRF2D3W0D1 207 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 MSRAQ9UJ68 235 aa24.53■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0C4DFX4 3053 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 PBX2P40425 430 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 RAB30Q15771 203 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 COL20A1Q9P218 1284 aa24.52■■□□□ 1.52
NEDD8-201ENST00000250495 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 ARIH2O95376 493 aa24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 GH1P01241 217 aa24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2C9P11712 490 aa24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CHMLP26374 656 aa24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 SCLYQ96I15 445 aa24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 ERICH2A1L162 156 aa24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CFBP00751 764 aa24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 PFKMP08237 780 aa24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 TRAF1Q13077 416 aa24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 MYO9BQ13459 2157 aa24.5■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB5O15062 677 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CYP21A2P08686 494 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 PTH1RQ03431 593 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 LY6KQ17RY6 165 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 RETREG2Q8NC44 543 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR8Q96EF0 704 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 NR3C2P08235 984 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CUL9Q8IWT3 2517 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 NCOA7Q8NI08 942 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 AFG1LQ8WV93 481 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 PXMP2Q9NR77 195 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 NOD1Q9Y239 953 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 MMP3P08254 477 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 RFC2P35250 354 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 HSD17B4P51659 736 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 GHRHRQ02643 423 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP1Q07960 439 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CHST3Q7LGC8 479 aa24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 ZBBXA8MT70 800 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 PITPNM1O00562 1244 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 CHMP4BP1P59074 171 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 BFSP2Q13515 415 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 GRM4Q14833 912 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 WTAPQ15007 396 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.46■■□□□ 1.51
NEDD8-201ENST00000250495 E7EWF7 191 aa24.45■■□□□ 1.5
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