RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 NOD1Q9Y239 953 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF292O60281 2723 aa19.65■□□□□ 0.74
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa19.64■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa19.64■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 TKFCQ3LXA3 575 aa19.64■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 EP400NLQ6ZTU2 488 aa19.64■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 ERMP1Q7Z2K6 904 aa19.64■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 OR6J1Q8NGC5 347 aa19.64■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.64■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 CRBNQ96SW2 442 aa19.64■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 CLDND1Q9NY35 253 aa19.64■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 GOLIM4O00461 696 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB14O75071 495 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 PTGISQ16647 500 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 EPC2Q52LR7 807 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 RPAINQ86UA6 219 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 AACSQ86V21 672 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 INSL6Q9Y581 213 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 NCOR2Q9Y618 2525 aa19.63■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 H3BNC9 293 aa19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 MBTPS2O43462 519 aa19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 PARNO95453 639 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 ADD2P35612 726 aa19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 MUM1L1Q5H9M0 696 aa19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL6Q8N531 539 aa19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.62■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 A6NJR5 290 aa19.61■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 KPNA6O60684 536 aa19.61■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 ALAS1P13196 640 aa19.61■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 DMXL1Q9Y485 3027 aa19.61■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 RAD50Q92878 1312 aa19.6■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 PROB1E7EW31 1015 aa19.6■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 BMP3P12645 472 aa19.6■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 SESTD1Q86VW0 696 aa19.6■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.6■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.6■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa19.6■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM232C9JQI7 657 aa19.59■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 CKBP12277 381 aa19.59■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 VCPP55072 806 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 CEP95Q96GE4 821 aa19.59■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SPCS1-201ENST00000233025 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 NCK2O43639 380 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CHGBP05060 677 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ZXDAP98168 799 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 MBTPS1Q14703 1052 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 COPS5Q92905 334 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 MTMR4Q9NYA4 1195 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa19.58■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.57■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 TBX10O75333 385 aa19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R5BQ15173 497 aa19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 SLFN13Q68D06 897 aa19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 NSMFQ6X4W1 530 aa19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ASCL5Q7RTU5 278 aa19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 PLIN4Q96Q06 1357 aa19.57■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 SBK1Q52WX2 424 aa19.56■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 FAM160B2Q86V87 743 aa19.56■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO11Q86XK2 927 aa19.56■□□□□ 0.72
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