RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185679.1

Gm28590-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28590, Length 1,609 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ube2q1Q7TSS2 422 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Acnat2Q8BGG9 420 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Zswim3Q8CFL8 695 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Pidd1Q9ERV7 915 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Psmd10Q9Z2X2 231 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Dnai2A2AC93 623 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Zbtb21E9Q444 1094 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Gm8882E9Q7E4 283 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Gja8P28236 440 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Sap130Q8BIH0 1057 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Iws1Q8C1D8 766 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Rgs19Q9CX84 216 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa14.64□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 U2af2P26369 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Cst8P32766 142 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ubash3aQ3V3E1 624 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Rhpn1Q61085 643 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Hsdl1Q8BTX9 330 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Nob1Q8BW10 403 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Kcnj14Q8JZN3 434 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Oxnad1Q8VE38 311 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 HttP42859 3119 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Dnaaf5B9EJR8 853 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ankrd35E9Q9D8 996 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 NfkbieO54910 364 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Mx1P09922 631 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 SqleP52019 572 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 PRAG1Q571I4 1179 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ptger2Q62053 362 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Nap1l3Q794H2 544 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Cyp26b1Q811W2 512 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Cdan1Q8CC12 1239 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Lrrc56Q8K375 552 aa14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 PfasQ5SUR0 1337 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Rnf19bA2A7Q9 732 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Pgk2P09041 417 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Kifap3P70188 793 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Kmt5bQ3U8K7 883 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ccdc85aQ5SP85 500 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ddx4Q61496 702 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ssh1Q76I79 1042 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Fbxo10Q7TQF2 950 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Kdm4aQ8BW72 1064 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Depdc1aQ8CIG0 804 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Q8K2W9 541 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Plcd1Q8R3B1 756 aa14.62□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Plcb2A3KGF7 1181 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Slc6a20bO88575 635 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Cplx1P63040 134 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Tff2Q03404 129 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Gcnt1Q09324 428 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Fam89aQ14BJ1 175 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Osbpl2Q8BX94 484 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Etnk1Q9D4V0 363 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ubiad1Q9DC60 336 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Tfcp2Q9ERA0 502 aa14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Plxnb3Q9QY40 1902 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Astn1Q61137 1302 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 CatspereP0DP43 985 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Btbd1P58544 488 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 PhkbQ7TSH2 1085 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Vps37dQ810I0 261 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Prkag3Q8BGM7 489 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Zbtb9Q8CDC7 459 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Rhobtb2Q91V93 728 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Smc1bQ920F6 1248 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Znf687Q9D2D7 1237 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Igbp1bQ9QZ29 343 aa14.6□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 MthfslL7N466 203 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Gdf10P97737 476 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 NfibP97863 570 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Pou2f2Q00196 463 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Tmem63bQ3TWI9 832 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Arhgef2Q60875 985 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Churc1Q6DG52 112 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Spata7Q80VP2 582 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 TbcbQ9D1E6 244 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Azi2Q9QYP6 405 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Ubxn8Q9QZ49 277 aa14.59□□□□□ -0.07
Gm28590-201ENSMUST00000185679 Homer1Q9Z2Y3 366 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.6 ms