RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pramef17A2ASJ1 475 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4758L7N258 96 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stra6O70491 670 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phka1P18826 1241 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atg4cQ811C2 458 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Alg3Q8K2A8 438 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ca9Q8VHB5 437 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GldcQ91W43 1025 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Anapc4Q91W96 807 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bhmt2Q91WS4 363 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubxn8Q9QZ49 277 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk39Q9Z1W9 556 aa26.08■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap4B1AUY3 965 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AunipE9Q6Z5 340 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SrprbP47758 269 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Palb2Q3U0P1 1104 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc33Q3ULW6 985 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tp53i13Q5F267 385 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fscn1Q61553 493 aa26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pgap3A2A559 320 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EvcP57680 1005 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ipo8Q7TMY7 1010 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prr11Q8BHE0 368 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrc5C3VPR6 1915 aa26.06■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stat1P42225 749 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppfia3P60469 1194 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defb19Q8K3I8 83 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgd4Q91ZT5 766 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tob2Q9JM55 345 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa26.05■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajc25A2ALW5 357 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm20503G3UZK1 150 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Itgb5O70309 798 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FosP01101 380 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf1bP97358 586 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xxylt1Q3U4G3 392 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam189a2Q4FZH1 290 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc2Q8VDB8 371 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rufy3Q9D394 469 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chmp4cQ9D7F7 232 aa26.04■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Skor2A7M7C7 1008 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr67F8VPJ8 320 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 StrnO55106 780 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gna11P21278 359 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cndp2Q9D1A2 475 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tekt1Q9DAJ2 418 aa26.03■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jakmip2D3YXK0 820 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb21E9Q444 1094 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gucy1a2F8VQK3 730 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cops5O35864 334 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tdo2P48776 406 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2c38P56655 490 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GaaP70699 953 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nacc1Q7TSZ8 514 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Iffo2Q8R2V2 512 aa26.02■■□□□ 1.76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EngaseQ8BX80 734 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bicd2Q921C5 820 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Limd1Q9QXD8 668 aa26.01■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnnm3Q32NY4 713 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf207Q3V3A7 635 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slitrk3Q810B9 980 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vps53Q8CCB4 832 aa26■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csf2raQ00941 388 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctdnep1Q3TP92 244 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PomkQ3TUA9 349 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Parp3Q3ULW8 533 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Elf1Q60775 612 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CtsqQ91ZF4 343 aa25.99■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhtkd1A2ATU0 921 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glud1P26443 558 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syt2P46097 422 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap1Q5FWK3 439 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smoc2Q8CD91 447 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agbl2Q8CDK2 862 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kbtbd4Q8R179 534 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FibpQ9JI19 357 aa25.98■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KinQ8K339 391 aa25.97■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp2a1Q8R429 994 aa25.97■■□□□ 1.75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sbno2Q7TNB8 1349 aa25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.2 ms