RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000017530.3

Traf4-201, Transcript of TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Traf4, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pcdha4O88689 947 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Stat3P42227 770 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Abcd1P48410 736 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Slc2a13Q3UHK1 637 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Plcg2Q8CIH5 1265 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 F11Q91Y47 624 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 CutaQ9CQ89 177 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Etnk2A7MCT6 385 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Abcb4P21440 1276 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 SarsP26638 512 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Rad23aP54726 363 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tfr2Q9JKX3 798 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ercc4Q9QZD4 917 aa28.09■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Mroh8E9PYI4 1049 aa28.08■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Mmp14P53690 582 aa28.08■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Chp1P61022 195 aa28.08■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Klrg2Q3UM83 387 aa28.08■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hdac9Q99N13 588 aa28.08■■■□□ 2.09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Clrn2B2RVW2 232 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 AoahO35298 574 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pip4k2aO70172 405 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Psmb7P70195 277 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Cyp2c67Q569X9 491 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ddx19bQ8BZY3 494 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lrrc41Q8K1C9 807 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tut1Q8R3F9 869 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fam76aQ922G2 307 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Acot3Q9QYR7 432 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ly6iQ9WU67 134 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 AgtP11859 477 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Znf280dQ68FE8 974 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Anapc4Q91W96 807 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 March8Q9DBD2 286 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 ChmQ9QXG2 665 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fam205a1D3YZF6 1314 aa28.07■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Prss51A0A286YDY8 319 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Rad51bO35719 350 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Paxbp1P58501 919 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Siah1bQ06985 282 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Foxd1Q61345 456 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hoxa13Q62424 386 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Exoc8Q6PGF7 716 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Mindy1Q76LS9 468 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Epn1Q80VP1 575 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ubiad1Q9DC60 336 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Chrna9G3X8Z7 479 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 CtshP49935 333 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pstpip1P97814 415 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dcaf8Q8N7N5 591 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Nap1l5Q9JJF0 156 aa28.06■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Magea10A2AMW4 325 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Psmc2P46471 433 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Mettl14Q3UIK4 456 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Phldb2Q8K1N2 1249 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Psmd2Q8VDM4 908 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Havcr2Q8VIM0 281 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fam217aQ9D9W6 419 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dnajc7Q9QYI3 494 aa28.05■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Flt1P35969 1333 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Cnbd1B1AWM0 430 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Zfp781Q0P5U5 243 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Xxylt1Q3U4G3 392 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Rexo1Q7TT28 1213 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tmem39bQ810L4 492 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 D130040H23RikQ8BII3 405 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 MtrA6H5Y3 1253 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ccdc6D3YZP9 469 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 IkbkbO88351 757 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 PtgdrP70263 357 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Uri1Q3TLD5 531 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lrrc36Q3V0M2 755 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Bst2Q8R2Q8 172 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ddah1Q9CWS0 285 aa28.04■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 FosP01101 380 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Prl2c2P04095 224 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Prr7Q3V0I2 269 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Vgll2Q8BGW8 322 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Spata4Q8K3V1 295 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Kbtbd4Q8R179 534 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Grin3bQ91ZU9 1003 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Txnrd2Q9JLT4 524 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 NpcdF8VQB8 469 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Esr2O08537 530 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tal1P22091 329 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Atp13a3Q5XF89 1219 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Haus2Q9CQS9 234 aa28.03■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Nsun7Q14AW5 724 aa28.02■■■□□ 2.08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ttc26Q8BS45 554 aa28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.3 ms