RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002112.14

Trappc6a-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6a, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Wasf1Q8R5H6 559 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Lrrc2Q8VDB8 371 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rgs19Q9CX84 216 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Hic1Q9R1Y5 733 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Oip5A2AQ14 241 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 TroapB7ZNG4 668 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GlrbP48168 496 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tdo2P48776 406 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atg4cQ811C2 458 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kctd3Q8BFX3 815 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Q8C5S3 137 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Bhmt2Q91WS4 363 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tob2Q9JM55 345 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Scnn1bQ9WU38 638 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Lamb2Q61292 1799 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zbtb21E9Q444 1094 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kcna2P63141 499 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 B230104I21RikQ3USW4 141 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Etaa1Q5SVT3 877 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 CerkQ8K4Q7 531 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Capn10Q9ESK3 666 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pgap3A2A559 320 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Arhgap4B1AUY3 965 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Olfr67F8VPJ8 320 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nr5a1P33242 462 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pla2g4eQ50L42 875 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fscn1Q61553 493 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Phlda1Q62392 405 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zfp943Q6NZP4 507 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nacc1Q7TSZ8 514 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Slitrk3Q810B9 980 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ccdc7Q9D541 371 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm10093D3YYI8 482 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Itgb5O70309 798 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Stra6O70491 670 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Phka1P18826 1241 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cnnm3Q32NY4 713 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tp53i13Q5F267 385 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tekt1Q9DAJ2 418 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 StrnO55106 780 aa20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ctdnep1Q3TP92 244 aa20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ccdc33Q3ULW6 985 aa20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GldcQ91W43 1025 aa20.32■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 AunipE9Q6Z5 340 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Syt1P46096 421 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GaaP70699 953 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Taf1bP97358 586 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Col19a1Q0VF58 1136 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Palb2Q3U0P1 1104 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rnf207Q3V3A7 635 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Elf1Q60775 612 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Crlf2Q8CII9 359 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kbtbd4Q8R179 534 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ca9Q8VHB5 437 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 CtsqQ91ZF4 343 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kctd10Q922M3 315 aa20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Jakmip2D3YXK0 820 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cyp3a25O09158 503 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kmt5bQ3U8K7 883 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Slc27a1Q60714 646 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kcnv2Q8CFS6 562 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Bud13Q8R149 637 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 FibpQ9JI19 357 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Limd1Q9QXD8 668 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa20.3■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fam189a2Q4FZH1 290 aa20.29■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kcnk18Q6VV64 394 aa20.29■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ccdc81Q9D5W4 654 aa20.29■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 HttP42859 3119 aa20.29■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dnajc25A2ALW5 357 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dhtkd1A2ATU0 921 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm20503G3UZK1 150 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Timm44O35857 452 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cops5O35864 334 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 FanccP50652 591 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Znf652Q5DU09 608 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Vps53Q8CCB4 832 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Defb19Q8K3I8 83 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ces1Q8VCC2 565 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fgd4Q91ZT5 766 aa20.28■□□□□ 0.84
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nlrc5C3VPR6 1915 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.5 ms