RNA–Protein interactions for RNA: YOR346W

REV1, Transcript of Deoxycytidyl transferase, yeast

Gene REV1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REV1	YOR346W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REV1	YOR346W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REV1	YOR346W	ERF2	Q06551	359 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REV1	YOR346W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REV1	YOR346W	PEX21	P50091	288 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REV1	YOR346W	NIS1	P53939	407 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REV1	YOR346W	AGE1	Q04412	482 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REV1	YOR346W	SIT4	P20604	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	SRC1	Q03707	834 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	LEU3	P08638	886 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	KEX2	P13134	814 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	GLC3	P32775	704 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	RAS1	P01119	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	CLB5	P30283	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	TEA1	P47988	759 aa		4.73	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	SAS4	Q04003	481 aa		4.72	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	FPK1	P53739	893 aa		4.71	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	GYP1	Q08484	637 aa		4.71	□□□□□ -1.65
REV1	YOR346W	CST6	P40535	587 aa		4.7	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	AIM7	Q12156	149 aa		4.7	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	MOD5	P07884	428 aa		4.7	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	RTF1	P53064	558 aa		4.69	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	TUB4	P53378	473 aa		4.69	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	SCJ1	P25303	377 aa		4.69	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	AMS1	P22855	1083 aa		4.68	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	RRN7	P40992	514 aa		4.68	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	YNL115C	P53925	644 aa		4.68	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	HST2	P53686	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	NPL4	P33755	580 aa		4.67	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	CLA4	P48562	842 aa		4.67	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	LAM6	Q08001	693 aa		4.67	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
REV1	YOR346W	RSC30	P38781	883 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	BDP1	P46678	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	YJU3	P28321	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	ATF2	P53296	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	KIN1	P13185	1064 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	ESS1	P22696	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	SLY41	P22215	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	TPD3	P31383	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	MMP1	Q12372	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REV1	YOR346W	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.59	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	ERG12	P07277	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
REV1	YOR346W	CSN12	P47130	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	HXT10	P43581	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	PUS5	Q06244	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	PUS6	P53294	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	RPA14	P50106	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	MET32	Q12041	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	RAD59	Q12223	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	HED1	Q03937	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REV1	YOR346W	TRK1	P12685	1235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.51	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	ITT1	Q04638	464 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	KXD1	P53158	218 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	ALR1	Q08269	859 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	CDC4	P07834	779 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	VAC17	P25591	423 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	PKC1	P24583	1151 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	HPC2	Q01448	625 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	ARG8	P18544	423 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	TBF1	Q02457	562 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	FIG4	P42837	879 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	TFB3	Q03290	321 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
REV1	YOR346W	AFT1	P22149	690 aa		4.45	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	LEO1	P38439	464 aa		4.45	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	BIO2	P32451	375 aa		4.44	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	ASH1	P34233	588 aa		4.43	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	BRE2	P43132	505 aa		4.43	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	APL6	P46682	809 aa		4.42	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	IXR1	P33417	597 aa		4.41	□□□□□ -1.7
REV1	YOR346W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7

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