RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		29.75	■■■□□ 2.35
ME2-216	ENST00000639850	ROCK1	Q13464	1354 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ME2-216	ENST00000639850	KDM6B	O15054	1643 aa		29.72	■■■□□ 2.35
ME2-216	ENST00000639850	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.71	■■■□□ 2.35
ME2-216	ENST00000639850	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.71	■■■□□ 2.35
ME2-216	ENST00000639850	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ME2-216	ENST00000639850	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ME2-216	ENST00000639850	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
ME2-216	ENST00000639850	TRIM52	Q96A61	297 aa		29.66	■■■□□ 2.34
ME2-216	ENST00000639850	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		29.61	■■■□□ 2.33
ME2-216	ENST00000639850	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ME2-216	ENST00000639850	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	29.6	■■■□□ 2.33
ME2-216	ENST00000639850	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ME2-216	ENST00000639850	TONSL	Q96HA7	1378 aa		29.57	■■■□□ 2.32
ME2-216	ENST00000639850	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
ME2-216	ENST00000639850	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	29.54	■■■□□ 2.32
ME2-216	ENST00000639850	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		29.54	■■■□□ 2.32
ME2-216	ENST00000639850	NCOA1	Q15788	1441 aa		29.53	■■■□□ 2.32
ME2-216	ENST00000639850	ADGRL2	O95490	1459 aa		29.52	■■■□□ 2.32
ME2-216	ENST00000639850	MIER1	Q8N108	512 aa		29.51	■■■□□ 2.31
ME2-216	ENST00000639850	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ME2-216	ENST00000639850	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ME2-216	ENST00000639850	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		29.47	■■■□□ 2.31
ME2-216	ENST00000639850	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		29.45	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.43	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29.41	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.41	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	29.41	■■■□□ 2.3	2e-7	■■■■■ 47.7
ME2-216	ENST00000639850	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	TSPY4	P0CV99	314 aa		29.39	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	TSPY10	P0CW01	314 aa		29.39	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.39	■■■□□ 2.3
ME2-216	ENST00000639850	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	FOXD1	Q16676	465 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	MBD5	Q9P267	1494 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.35	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.34	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	KCNH8	Q96L42	1107 aa		29.34	■■■□□ 2.29
ME2-216	ENST00000639850	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ME2-216	ENST00000639850	PZP	P20742	1482 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ME2-216	ENST00000639850	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ME2-216	ENST00000639850	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ME2-216	ENST00000639850	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
ME2-216	ENST00000639850	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		29.27	■■■□□ 2.28
ME2-216	ENST00000639850	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ME2-216	ENST00000639850	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
ME2-216	ENST00000639850	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ME2-216	ENST00000639850	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
ME2-216	ENST00000639850	PLCH2	O75038	1416 aa		29.2	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		29.2	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		29.19	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.18	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.18	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	NUP155	O75694	1391 aa		29.17	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	PKD2	Q13563	968 aa		29.16	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		29.14	■■■□□ 2.26
ME2-216	ENST00000639850	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.14	■■■□□ 2.25
ME2-216	ENST00000639850	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
ME2-216	ENST00000639850	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		29.11	■■■□□ 2.25
ME2-216	ENST00000639850	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ME2-216	ENST00000639850	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ME2-216	ENST00000639850	PLXNC1	O60486	1568 aa		29.07	■■■□□ 2.24
ME2-216	ENST00000639850	ABCC1	P33527	1531 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ME2-216	ENST00000639850	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		29.05	■■■□□ 2.24
ME2-216	ENST00000639850	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.98	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	UNC13B	O14795	1591 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ME2-216	ENST00000639850	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.92	■■■□□ 2.22
ME2-216	ENST00000639850	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ME2-216	ENST00000639850	FANCA	O15360	1455 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ME2-216	ENST00000639850	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.89	■■■□□ 2.22
ME2-216	ENST00000639850	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ME2-216	ENST00000639850	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ME2-216	ENST00000639850	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ME2-216	ENST00000639850	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ME2-216	ENST00000639850	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.83	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	ANP32C	O43423	234 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		28.76	■■■□□ 2.2
ME2-216	ENST00000639850	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.76	■■■□□ 2.19
ME2-216	ENST00000639850	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.76	■■■□□ 2.19
ME2-216	ENST00000639850	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ME2-216	ENST00000639850	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19

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