RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637021.1

NRXN1-253, Transcript of neurexin 1, human

TSL 5

Gene NRXN1, Length 121 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-253	ENST00000637021	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	ATP10A	O60312	1499 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NRXN1-253	ENST00000637021	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	AGL	P35573	1532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	PLCH2	O75038	1416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	NPAT	Q14207	1427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	KDM5C	P41229	1560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	PKD2	Q13563	968 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	MLEC	Q14165	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	C3	P01024	1663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NRXN1-253	ENST00000637021	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	CPS1	P31327	1500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	TOM1	O60784	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	RNF39	Q9H2S5	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	HSPA1L	P34931	641 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ALK	Q9UM73	1620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	MED14	O60244	1454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NRXN1-253	ENST00000637021	ABCC1	P33527	1531 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	EEA1	Q15075	1411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	KIF14	Q15058	1648 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	CLIP1	P30622	1438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	SYNM	O15061	1565 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	A2M	P01023	1474 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	PZP	P20742	1482 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NRXN1-253	ENST00000637021	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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