RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623103.1

C9orf62-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 62, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf62, Length 1,924 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62-201ENST00000623103 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
C9orf62-201ENST00000623103 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf62-201ENST00000623103 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf62-201ENST00000623103 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf62-201ENST00000623103 ATP10BO94823 1461 aa24.61■■□□□ 1.53
C9orf62-201ENST00000623103 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.61■■□□□ 1.53
C9orf62-201ENST00000623103 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.57■■□□□ 1.52
C9orf62-201ENST00000623103 KIF14Q15058 1648 aa24.57■■□□□ 1.52
C9orf62-201ENST00000623103 DAPK1P53355 1430 aa24.56■■□□□ 1.52
C9orf62-201ENST00000623103 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.56■■□□□ 1.52
C9orf62-201ENST00000623103 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.56■■□□□ 1.52
C9orf62-201ENST00000623103 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
C9orf62-201ENST00000623103 KDM6BO15054 1643 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 ROCK1Q13464 1354 aa24.51■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 TONSLQ96HA7 1378 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.49■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 ABCC5O15440 1437 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.48■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
C9orf62-201ENST00000623103 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
C9orf62-201ENST00000623103 TRIM52Q96A61 297 aa24.43■■□□□ 1.5
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
C9orf62-201ENST00000623103 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.43■■□□□ 1.5
C9orf62-201ENST00000623103 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
C9orf62-201ENST00000623103 ASXL2Q76L83 1435 aa24.4■■□□□ 1.5
C9orf62-201ENST00000623103 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.37■■□□□ 1.49
C9orf62-201ENST00000623103 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.37■■□□□ 1.49
C9orf62-201ENST00000623103 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
C9orf62-201ENST00000623103 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
C9orf62-201ENST00000623103 ADGRL2O95490 1459 aa24.33■■□□□ 1.49
C9orf62-201ENST00000623103 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.32■■□□□ 1.48
C9orf62-201ENST00000623103 PREX2Q70Z35 1606 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf62-201ENST00000623103 NCOA1Q15788 1441 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf62-201ENST00000623103 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.28■■□□□ 1.48
C9orf62-201ENST00000623103 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf62-201ENST00000623103 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf62-201ENST00000623103 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf62-201ENST00000623103 DIP2BQ9P265 1576 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf62-201ENST00000623103 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.22■■□□□ 1.47
C9orf62-201ENST00000623103 KCNH8Q96L42 1107 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 GLI2P10070 1586 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 PZPP20742 1482 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 FOXD1Q16676 465 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf62-201ENST00000623103 TSPY4P0CV99 314 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 TSPY10P0CW01 314 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.13■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.12■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.12■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 MBD5Q9P267 1494 aa24.09■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.08■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.08■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.08■■□□□ 1.45
C9orf62-201ENST00000623103 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.07■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 PLCH2O75038 1416 aa24.07■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.06■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.06■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.06■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 KIF15Q9NS87 1388 aa24.05■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.05■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 CD109Q6YHK3 1445 aa24.05■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.05■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.03■■□□□ 1.44
C9orf62-201ENST00000623103 NUP155O75694 1391 aa23.99■■□□□ 1.43
C9orf62-201ENST00000623103 PKD2Q13563 968 aa23.98■■□□□ 1.43
C9orf62-201ENST00000623103 CCER2I3L3R5 266 aa23.98■■□□□ 1.43
C9orf62-201ENST00000623103 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
C9orf62-201ENST00000623103 PLXNC1O60486 1568 aa23.97■■□□□ 1.43
C9orf62-201ENST00000623103 ANP32CO43423 234 aa23.96■■□□□ 1.43
C9orf62-201ENST00000623103 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
C9orf62-201ENST00000623103 FANCAO15360 1455 aa23.94■■□□□ 1.42
C9orf62-201ENST00000623103 TSPOAP1O95153 1857 aa23.94■■□□□ 1.42
C9orf62-201ENST00000623103 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
C9orf62-201ENST00000623103 UNC13BO14795 1591 aa23.92■■□□□ 1.42
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.91■■□□□ 1.42
C9orf62-201ENST00000623103 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
C9orf62-201ENST00000623103 NEO1Q92859 1461 aa23.89■■□□□ 1.42
C9orf62-201ENST00000623103 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.89■■□□□ 1.41
C9orf62-201ENST00000623103 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.88■■□□□ 1.41
C9orf62-201ENST00000623103 ABCC1P33527 1531 aa23.88■■□□□ 1.41
C9orf62-201ENST00000623103 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.88■■□□□ 1.41
C9orf62-201ENST00000623103 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms