RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621995.1

RAD9A-210, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component A, humanhuman

TSL 3

Gene RAD9A, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9A-210ENST00000621995 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.17■■■■■ 4.34
RAD9A-210ENST00000621995 HECW1Q76N89 1606 aa42.16■■■■■ 4.34
RAD9A-210ENST00000621995 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
RAD9A-210ENST00000621995 CLIP1P30622 1438 aa42.15■■■■■ 4.34
RAD9A-210ENST00000621995 PLCH2O75038 1416 aa42.12■■■■■ 4.33
RAD9A-210ENST00000621995 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.12■■■■■ 4.33
RAD9A-210ENST00000621995 MLECQ14165 292 aa42.09■■■■■ 4.33
RAD9A-210ENST00000621995 CEP162Q5TB80 1403 aa42.06■■■■■ 4.32
RAD9A-210ENST00000621995 FMN1Q68DA7 1419 aa42.05■■■■■ 4.32
RAD9A-210ENST00000621995 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.04■■■■■ 4.32
RAD9A-210ENST00000621995 ATP10AO60312 1499 aa41.98■■■■■ 4.31
RAD9A-210ENST00000621995 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.96■■■■■ 4.31
RAD9A-210ENST00000621995 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.95■■■■■ 4.31
RAD9A-210ENST00000621995 CERKQ8TCT0 537 aa41.95■■■■■ 4.31
RAD9A-210ENST00000621995 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.93■■■■■ 4.3
RAD9A-210ENST00000621995 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.9■■■■■ 4.3
RAD9A-210ENST00000621995 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
RAD9A-210ENST00000621995 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
RAD9A-210ENST00000621995 KIF14Q15058 1648 aa41.83■■■■■ 4.29
RAD9A-210ENST00000621995 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
RAD9A-210ENST00000621995 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.81■■■■■ 4.28
RAD9A-210ENST00000621995 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.8■■■■■ 4.28
RAD9A-210ENST00000621995 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.79■■■■■ 4.28
RAD9A-210ENST00000621995 AFAP1Q8N556 730 aa41.76■■■■■ 4.28
RAD9A-210ENST00000621995 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
RAD9A-210ENST00000621995 KDM5CP41229 1560 aa41.76■■■■■ 4.27
RAD9A-210ENST00000621995 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.73■■■■■ 4.27
RAD9A-210ENST00000621995 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.73■■■■■ 4.27
RAD9A-210ENST00000621995 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.72■■■■■ 4.27
RAD9A-210ENST00000621995 STRCQ7RTU9 1775 aa41.66■■■■■ 4.26
RAD9A-210ENST00000621995 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.66■■■■■ 4.26
RAD9A-210ENST00000621995 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.64■■■■■ 4.26
RAD9A-210ENST00000621995 REREQ9P2R6 1566 aa41.63■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.62■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.61■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.6■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.59■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.58■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 ABCA6Q8N139 1617 aa41.57■■■■■ 4.25
RAD9A-210ENST00000621995 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.55■■■■■ 4.24
RAD9A-210ENST00000621995 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.52■■■■■ 4.24
RAD9A-210ENST00000621995 AGLP35573 1532 aa41.51■■■■■ 4.24
RAD9A-210ENST00000621995 C3P01024 1663 aa41.5■■■■■ 4.23
RAD9A-210ENST00000621995 ABCC1P33527 1531 aa41.49■■■■■ 4.23
RAD9A-210ENST00000621995 PREX2Q70Z35 1606 aa41.48■■■■■ 4.23
RAD9A-210ENST00000621995 PTPRTO14522 1441 aa41.44■■■■■ 4.23
RAD9A-210ENST00000621995 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.42■■■■■ 4.22
RAD9A-210ENST00000621995 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
RAD9A-210ENST00000621995 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.38■■■■■ 4.22
RAD9A-210ENST00000621995 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.34■■■■■ 4.21
RAD9A-210ENST00000621995 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.32■■■■■ 4.21
RAD9A-210ENST00000621995 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.31■■■■■ 4.2
RAD9A-210ENST00000621995 ILDR2Q71H61 639 aa41.31■■■■■ 4.2
RAD9A-210ENST00000621995 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.28■■■■■ 4.2
RAD9A-210ENST00000621995 NCOA1Q15788 1441 aa41.27■■■■■ 4.2
RAD9A-210ENST00000621995 TIAM1Q13009 1591 aa41.25■■■■■ 4.19
RAD9A-210ENST00000621995 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.25■■■■■ 4.19
RAD9A-210ENST00000621995 NPATQ14207 1427 aa41.19■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 MAP3K1Q13233 1512 aa41.19■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 MROH2AA6NES4 1674 aa41.18■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.16■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.16■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 ZMYM3Q14202 1370 aa41.15■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.14■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 SOCS7O14512 581 aa41.14■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
RAD9A-210ENST00000621995 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.13■■■■■ 4.17
RAD9A-210ENST00000621995 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
RAD9A-210ENST00000621995 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.11■■■■■ 4.17
RAD9A-210ENST00000621995 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
RAD9A-210ENST00000621995 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.07■■■■■ 4.16
RAD9A-210ENST00000621995 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.05■■■■■ 4.16
RAD9A-210ENST00000621995 ATP7AQ04656 1500 aa41.04■■■■■ 4.16
RAD9A-210ENST00000621995 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.03■■■■■ 4.16
RAD9A-210ENST00000621995 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.03■■■■■ 4.16
RAD9A-210ENST00000621995 PLXNC1O60486 1568 aa41.02■■■■■ 4.16
RAD9A-210ENST00000621995 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 A2MP01023 1474 aa40.99■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.99■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 PTPRKQ15262 1439 aa40.95■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.15
RAD9A-210ENST00000621995 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.94■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 PLA2R1Q13018 1463 aa40.94■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.92■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 PKD2Q13563 968 aa40.92■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 GGT6Q6P531 493 aa40.91■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 NCOA2Q15596 1464 aa40.89■■■■■ 4.14
RAD9A-210ENST00000621995 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.85■■■■■ 4.13
RAD9A-210ENST00000621995 APLP2Q06481 763 aa40.84■■■■■ 4.13
RAD9A-210ENST00000621995 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.83■■■■■ 4.13
RAD9A-210ENST00000621995 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.5 ms