RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617053.2

PNMA8C-201, Transcript of PNMA family member 8C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8C, Length 4,255 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8C-201ENST00000617053 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.73□□□□□ -0.37
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PNMA8C-201ENST00000617053 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.72□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.7□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 PBRM1Q86U86 1689 aa12.69□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.69□□□□□ -0.38
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PNMA8C-201ENST00000617053 C14orf37Q86TY3 774 aa12.69□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 HECW1Q76N89 1606 aa12.66□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 KIF3BO15066 747 aa12.66□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.65□□□□□ -0.38
PNMA8C-201ENST00000617053 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.64□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 FKBP8Q14318 412 aa12.63□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.63□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC24A1O60721 1099 aa12.63□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 MAP3K1Q13233 1512 aa12.63□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.63□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 PKD2Q13563 968 aa12.62□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 WDR97A6NE52 1622 aa12.61□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.6□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.6□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 AFAP1Q8N556 730 aa12.6□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 NUP155O75694 1391 aa12.6□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 UACAQ9BZF9 1416 aa12.6□□□□□ -0.39
PNMA8C-201ENST00000617053 NUP160Q12769 1436 aa12.58□□□□□ -0.39
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PNMA8C-201ENST00000617053 DISP1Q96F81 1524 aa12.58□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.57□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 KIAA0556O60303 1618 aa12.57□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 MRS2Q9HD23 443 aa12.57□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 RAPGEF3O95398 923 aa12.56□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 CEP170Q5SW79 1584 aa12.56□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.56□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 MIA2Q96PC5 1412 aa12.54□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 CARD11Q9BXL7 1154 aa12.54□□□□□ -0.4
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PNMA8C-201ENST00000617053 SAMD9Q5K651 1589 aa12.54□□□□□ -0.4
PNMA8C-201ENST00000617053 ARHGEF11O15085 1522 aa12.54□□□□□ -0.4
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PNMA8C-201ENST00000617053 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.51□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP10BO94823 1461 aa12.51□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 A0A0G2JS52 829 aa12.51□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.41
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PNMA8C-201ENST00000617053 KIF15Q9NS87 1388 aa12.5□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 HFM1A2PYH4 1435 aa12.49□□□□□ -0.41
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PNMA8C-201ENST00000617053 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.49□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 NAIPQ13075 1403 aa12.49□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 DAPK1P53355 1430 aa12.48□□□□□ -0.41
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PNMA8C-201ENST00000617053 PTPRKQ15262 1439 aa12.48□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.48□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 NUTM2FA1L443 756 aa12.48□□□□□ -0.41
PNMA8C-201ENST00000617053 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.47□□□□□ -0.41
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PNMA8C-201ENST00000617053 ABCC5O15440 1437 aa12.45□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.45□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.44□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.44□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.44□□□□□ -0.42
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PNMA8C-201ENST00000617053 KANK1Q14678 1352 aa12.43□□□□□ -0.42
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PNMA8C-201ENST00000617053 KIF14Q15058 1648 aa12.42□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 CCER2I3L3R5 266 aa12.4□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 NEUROD2Q15784 382 aa12.4□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 CHD1O14646 1710 aa12.4□□□□□ -0.42
PNMA8C-201ENST00000617053 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.37□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 NCOA1Q15788 1441 aa12.37□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.37□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 ROCK1Q13464 1354 aa12.36□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 AKNAQ7Z591 1439 aa12.36□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 NEFMP07197 916 aa12.35□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.35□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.34□□□□□ -0.43
PNMA8C-201ENST00000617053 CCDC144AA2RUR9 1427 aa12.34□□□□□ -0.43
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PNMA8C-201ENST00000617053 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
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