RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRJ-207ENST00000613246 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRJ-207ENST00000613246 TPM3P06753 285 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX12O15370 315 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNH8Q96L42 1107 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-207ENST00000613246 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 VPS53Q5VIR6 699 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 WWC1Q8IX03 1113 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 PHF14O94880 888 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRJ-207ENST00000613246 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 GPATCH3Q96I76 525 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 GORABQ5T7V8 394 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 G3V3G9 751 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 MARCH6O60337 910 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 GPS2Q13227 327 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 SCRIBQ14160 1630 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-207ENST00000613246 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TPM2P07951 284 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TPM1P09493 284 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF16BQ96L93 1317 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF592Q92610 1267 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 TEX35Q5T0J7 233 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 H3BQV1 296 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 IFFO2Q5TF58 517 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 MORC1Q86VD1 984 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 TMF1P82094 1093 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 TOMM22Q9NS69 142 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRJ-207ENST00000613246 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP7D2Q96T17 732 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ST18O60284 1047 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF3AQ9Y496 699 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRJ-207ENST00000613246 BECN2A8MW95 431 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 RUFY1Q96T51 708 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM184AQ8NB25 1140 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.273e-7■■■■■ 181.7
PTPRJ-207ENST00000613246 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CLIP1P30622 1438 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 AK7Q96M32 723 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
PTPRJ-207ENST00000613246 APPP05067 770 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 HMMRO75330 724 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 HOMER1Q86YM7 354 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 STK31Q9BXU1 1019 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRJ-207ENST00000613246 MCTP1Q6DN14 999 aa22.93■■□□□ 1.26
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