RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CTCFL-222	ENST00000609232	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	14.08	□□□□□ -0.16	1e-10	■□□□□ 8.3
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CTCFL-222	ENST00000609232	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
CTCFL-222	ENST00000609232	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CTCFL-222	ENST00000609232	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	14.02	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP10B	O94823	1461 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		14	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	UACA	Q9BZF9	1416 aa		14	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		14	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPRK	Q15262	1439 aa		14	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CTCFL-222	ENST00000609232	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCA8	O94911	1581 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	NAIP	Q13075	1403 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF14	Q15058	1648 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	DAPK1	P53355	1430 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTCFL-222	ENST00000609232	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC5	O15440	1437 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTCFL-222	ENST00000609232	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
CTCFL-222	ENST00000609232	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	PKD2	Q13563	968 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	NUP155	O75694	1391 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM6B	O15054	1643 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21	3e-12	■■■■■ 30.2
CTCFL-222	ENST00000609232	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTCFL-222	ENST00000609232	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	PLCH2	O75038	1416 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	ANP32C	O43423	234 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.65	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	MLEC	Q14165	292 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	FKBP8	Q14318	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	FANCA	O15360	1455 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF3B	O15066	747 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTCFL-222	ENST00000609232	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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