RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594202.5

FCHO1-206, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-206ENST00000594202 CEP170Q5SW79 1584 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-206ENST00000594202 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-206ENST00000594202 SYNJ2O15056 1496 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-206ENST00000594202 ABCC5O15440 1437 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-206ENST00000594202 DAPK1P53355 1430 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-206ENST00000594202 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-206ENST00000594202 ARHGEF11O15085 1522 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.31■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.31■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 PKD2Q13563 968 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 MIA2Q96PC5 1412 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 KIF14Q15058 1648 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-206ENST00000594202 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.26■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 TSPY4P0CV99 314 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 TSPY10P0CW01 314 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 FKBP8Q14318 412 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 PTPRGP23470 1445 aa21.22■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-206ENST00000594202 CCDC184Q52MB2 194 aa21.21■□□□□ 0.99
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FCHO1-206ENST00000594202 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
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FCHO1-206ENST00000594202 RGL3Q3MIN7 710 aa21.18■□□□□ 0.98
FCHO1-206ENST00000594202 NUP155O75694 1391 aa21.17■□□□□ 0.98
FCHO1-206ENST00000594202 ATP10BO94823 1461 aa21.16■□□□□ 0.98
FCHO1-206ENST00000594202 NUP160Q12769 1436 aa21.16■□□□□ 0.98
FCHO1-206ENST00000594202 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.15■□□□□ 0.98
FCHO1-206ENST00000594202 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.13■□□□□ 0.97
FCHO1-206ENST00000594202 NCOA1Q15788 1441 aa21.13■□□□□ 0.97
FCHO1-206ENST00000594202 AKNAQ7Z591 1439 aa21.13■□□□□ 0.97
FCHO1-206ENST00000594202 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.12■□□□□ 0.97
FCHO1-206ENST00000594202 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.11■□□□□ 0.97
FCHO1-206ENST00000594202 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.11■□□□□ 0.97
FCHO1-206ENST00000594202 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.09■□□□□ 0.97
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FCHO1-206ENST00000594202 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.08■□□□□ 0.97
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FCHO1-206ENST00000594202 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.05■□□□□ 0.96
FCHO1-206ENST00000594202 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.05■□□□□ 0.96
FCHO1-206ENST00000594202 KIF15Q9NS87 1388 aa21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-206ENST00000594202 PZPP20742 1482 aa21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-206ENST00000594202 CCER2I3L3R5 266 aa21.04■□□□□ 0.96
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FCHO1-206ENST00000594202 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.03■□□□□ 0.96
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FCHO1-206ENST00000594202 ABCA8O94911 1581 aa20.96■□□□□ 0.95
FCHO1-206ENST00000594202 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.95■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 USP47Q96K76 1375 aa20.93■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.93■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.93■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 AFAP1Q8N556 730 aa20.91■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
FCHO1-206ENST00000594202 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.9■□□□□ 0.94
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FCHO1-206ENST00000594202 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.76■□□□□ 0.91
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FCHO1-206ENST00000594202 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.74■□□□□ 0.91
FCHO1-206ENST00000594202 TMC1Q8TDI8 760 aa20.74■□□□□ 0.91
FCHO1-206ENST00000594202 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
FCHO1-206ENST00000594202 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
FCHO1-206ENST00000594202 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.72■□□□□ 0.91
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FCHO1-206ENST00000594202 KIF3BO15066 747 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
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