RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593068.6

TMEM259-211, Transcript of transmembrane protein 259, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM259, Length 1,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259-211ENST00000593068 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.47■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.46■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.45■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 PREX2Q70Z35 1606 aa26.45■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 DAPK1P53355 1430 aa26.42■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.42■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 ABCC5O15440 1437 aa26.41■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 ASXL2Q76L83 1435 aa26.39■■□□□ 1.82
TMEM259-211ENST00000593068 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.39■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.38■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 HFM1A2PYH4 1435 aa26.37■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.37■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.37■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 NAIPQ13075 1403 aa26.36■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.35■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
TMEM259-211ENST00000593068 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.32■■□□□ 1.8
TMEM259-211ENST00000593068 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.3■■□□□ 1.8
TMEM259-211ENST00000593068 KDM6BO15054 1643 aa26.28■■□□□ 1.8
TMEM259-211ENST00000593068 PLCH2O75038 1416 aa26.28■■□□□ 1.8
TMEM259-211ENST00000593068 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.88e-11■■□□□ 12.6
TMEM259-211ENST00000593068 AKNAQ7Z591 1439 aa26.28■■□□□ 1.8
TMEM259-211ENST00000593068 MBD5Q9P267 1494 aa26.26■■□□□ 1.79
TMEM259-211ENST00000593068 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.25■■□□□ 1.79
TMEM259-211ENST00000593068 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.25■■□□□ 1.79
TMEM259-211ENST00000593068 ROCK1Q13464 1354 aa26.23■■□□□ 1.79
TMEM259-211ENST00000593068 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.23■■□□□ 1.79
TMEM259-211ENST00000593068 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.22■■□□□ 1.79
TMEM259-211ENST00000593068 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.19■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.18■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 MAPKBP1O60336 1514 aa26.18■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 NCOA1Q15788 1441 aa26.18■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 ADGRL2O95490 1459 aa26.17■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.17■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.16■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 ABCC1P33527 1531 aa26.15■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.15■■□□□ 1.78
TMEM259-211ENST00000593068 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.13■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.12■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 FANCAO15360 1455 aa26.12■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 TSPY4P0CV99 314 aa26.11■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 TSPY10P0CW01 314 aa26.11■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.11■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.08■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TMEM259-211ENST00000593068 CD109Q6YHK3 1445 aa26.06■■□□□ 1.76
TMEM259-211ENST00000593068 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.06■■□□□ 1.76
TMEM259-211ENST00000593068 TRIM52Q96A61 297 aa26.05■■□□□ 1.76
TMEM259-211ENST00000593068 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.04■■□□□ 1.76
TMEM259-211ENST00000593068 KIF15Q9NS87 1388 aa26.03■■□□□ 1.76
TMEM259-211ENST00000593068 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TMEM259-211ENST00000593068 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 ADGRL1O94910 1474 aa26■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 AFAP1Q8N556 730 aa26■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 PLXNC1O60486 1568 aa25.95■■□□□ 1.75
TMEM259-211ENST00000593068 DIP2BQ9P265 1576 aa25.95■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 NEUROD1Q13562 356 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 GLI2P10070 1586 aa25.92■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.92■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.92■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.9■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 PZPP20742 1482 aa25.9■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 FOXD1Q16676 465 aa25.89■■□□□ 1.74
TMEM259-211ENST00000593068 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TMEM259-211ENST00000593068 ATP7AQ04656 1500 aa25.85■■□□□ 1.73
TMEM259-211ENST00000593068 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TMEM259-211ENST00000593068 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.84■■□□□ 1.73
TMEM259-211ENST00000593068 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.84■■□□□ 1.73
TMEM259-211ENST00000593068 TSPOAP1O95153 1857 aa25.83■■□□□ 1.73
TMEM259-211ENST00000593068 NEO1Q92859 1461 aa25.83■■□□□ 1.73
TMEM259-211ENST00000593068 MIER1Q8N108 512 aa25.82■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.81■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 NUP155O75694 1391 aa25.81■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.81■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.79■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.78■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 KDM5CP41229 1560 aa25.77■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 ERBINQ96RT1 1412 aa25.77■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 UNC13BO14795 1591 aa25.76■■□□□ 1.72
TMEM259-211ENST00000593068 RAPGEF3O95398 923 aa25.76■■□□□ 1.71
TMEM259-211ENST00000593068 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.716e-8■□□□□ 9.3
TMEM259-211ENST00000593068 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM259-211ENST00000593068 PKD2Q13563 968 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM259-211ENST00000593068 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms