RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591762.1

SPHK1-209, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPHK1, Length 2,502 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-209ENST00000591762 ABCA8O94911 1581 aa25.23■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 ATP10BO94823 1461 aa25.22■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 KCNH8Q96L42 1107 aa25.22■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 KDM6BO15054 1643 aa25.22■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 ABCC5O15440 1437 aa25.22■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SPHK1-209ENST00000591762 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.19■■□□□ 1.62
SPHK1-209ENST00000591762 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SPHK1-209ENST00000591762 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.16■■□□□ 1.62
SPHK1-209ENST00000591762 AKNAQ7Z591 1439 aa25.16■■□□□ 1.62
SPHK1-209ENST00000591762 TONSLQ96HA7 1378 aa25.16■■□□□ 1.62
SPHK1-209ENST00000591762 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.14■■□□□ 1.62
SPHK1-209ENST00000591762 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.13■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 FOXD1Q16676 465 aa25.12■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 ROCK1Q13464 1354 aa25.11■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.1■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.09■■□□□ 1.61
SPHK1-209ENST00000591762 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.08■■□□□ 1.6
SPHK1-209ENST00000591762 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SPHK1-209ENST00000591762 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.04■■□□□ 1.6
SPHK1-209ENST00000591762 SHROOM2Q13796 1616 aa25.03■■□□□ 1.6
SPHK1-209ENST00000591762 NCOA1Q15788 1441 aa25■■□□□ 1.59
SPHK1-209ENST00000591762 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25■■□□□ 1.59
SPHK1-209ENST00000591762 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPHK1-209ENST00000591762 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.99■■□□□ 1.59
SPHK1-209ENST00000591762 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
SPHK1-209ENST00000591762 BCANQ96GW7 911 aa24.96■■□□□ 1.59
SPHK1-209ENST00000591762 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.93■■□□□ 1.58
SPHK1-209ENST00000591762 TSPY4P0CV99 314 aa24.91■■□□□ 1.58
SPHK1-209ENST00000591762 TSPY10P0CW01 314 aa24.91■■□□□ 1.58
SPHK1-209ENST00000591762 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.9■■□□□ 1.58
SPHK1-209ENST00000591762 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.89■■□□□ 1.58
SPHK1-209ENST00000591762 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 ADGRL2O95490 1459 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 ABCC2Q92887 1545 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 FKBP8Q14318 412 aa24.87■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.85■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 PZPP20742 1482 aa24.84■■□□□ 1.57
SPHK1-209ENST00000591762 BCL11AQ9H165 835 aa24.82■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.82■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 MBD5Q9P267 1494 aa24.81■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 PKD2Q13563 968 aa24.8■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.8■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.8■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.78■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 ANP32CO43423 234 aa24.78■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 PREX2Q70Z35 1606 aa24.78■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 KIF15Q9NS87 1388 aa24.77■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.77■■□□□ 1.56
SPHK1-209ENST00000591762 NUP155O75694 1391 aa24.76■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.74■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.73■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.73■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.72■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.72■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 CCER2I3L3R5 266 aa24.72■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 NEFLP07196 543 aa24.71■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.71■■□□□ 1.55
SPHK1-209ENST00000591762 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.69■■□□□ 1.54
SPHK1-209ENST00000591762 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
SPHK1-209ENST00000591762 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.67■■□□□ 1.54
SPHK1-209ENST00000591762 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
SPHK1-209ENST00000591762 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.64■■□□□ 1.54
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SPHK1-209ENST00000591762 PLCH2O75038 1416 aa24.62■■□□□ 1.53
SPHK1-209ENST00000591762 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.62■■□□□ 1.53
SPHK1-209ENST00000591762 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.538e-8■■■□□ 17.9
SPHK1-209ENST00000591762 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.61■■□□□ 1.53
SPHK1-209ENST00000591762 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.6■■□□□ 1.53
SPHK1-209ENST00000591762 OSCARQ8IYS5 282 aa24.57■■□□□ 1.52
SPHK1-209ENST00000591762 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.56■■□□□ 1.52
SPHK1-209ENST00000591762 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SPHK1-209ENST00000591762 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.53■■□□□ 1.52
SPHK1-209ENST00000591762 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
SPHK1-209ENST00000591762 AFAP1Q8N556 730 aa24.52■■□□□ 1.52
SPHK1-209ENST00000591762 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.51■■□□□ 1.51
SPHK1-209ENST00000591762 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.51■■□□□ 1.51
SPHK1-209ENST00000591762 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.5■■□□□ 1.51
SPHK1-209ENST00000591762 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.49■■□□□ 1.51
SPHK1-209ENST00000591762 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SPHK1-209ENST00000591762 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
SPHK1-209ENST00000591762 ABCC1P33527 1531 aa24.46■■□□□ 1.51
SPHK1-209ENST00000591762 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-209ENST00000591762 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-209ENST00000591762 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.43■■□□□ 1.5
SPHK1-209ENST00000591762 PLXNC1O60486 1568 aa24.43■■□□□ 1.5
SPHK1-209ENST00000591762 ASXL2Q76L83 1435 aa24.42■■□□□ 1.5
SPHK1-209ENST00000591762 CCDC7Q96M83 1385 aa24.42■■□□□ 1.5
SPHK1-209ENST00000591762 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.41■■□□□ 1.5
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