RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 HECW1Q76N89 1606 aa21.15■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.15■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 GRIN2AQ12879 1464 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 WDR62O43379 1518 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF11O15085 1522 aa21.09■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CTIF-205ENST00000587860 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-205ENST00000587860 FKBP8Q14318 412 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-205ENST00000587860 ABCC5O15440 1437 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-205ENST00000587860 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0556O60303 1618 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-205ENST00000587860 DAPK1P53355 1430 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-205ENST00000587860 CCDC184Q52MB2 194 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-205ENST00000587860 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 CEP170Q5SW79 1584 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.958e-7■■■■■ 28.7
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 MIA2Q96PC5 1412 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 PKD2Q13563 968 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
CTIF-205ENST00000587860 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 SYNJ2O15056 1496 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 KIF14Q15058 1648 aa20.93■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.91■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.91■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.89■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.89■□□□□ 0.94
CTIF-205ENST00000587860 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 CCER2I3L3R5 266 aa20.88■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 ARXQ96QS3 562 aa20.88■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.933e-6■□□□□ 8.8
CTIF-205ENST00000587860 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.86■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 NCOA1Q15788 1441 aa20.85■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 AKNAQ7Z591 1439 aa20.85■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 TSPY4P0CV99 314 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 TSPY10P0CW01 314 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-205ENST00000587860 NUP155O75694 1391 aa20.83■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.83■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 ATP10BO94823 1461 aa20.83■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 ROCK1Q13464 1354 aa20.81■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 RGL3Q3MIN7 710 aa20.81■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.8■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 PTPRGP23470 1445 aa20.8■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 NUP160Q12769 1436 aa20.79■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 NEFLP07196 543 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 MRS2Q9HD23 443 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 PZPP20742 1482 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 CCDC7Q96M83 1385 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHG5O94827 1062 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.73■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 KLHL34Q8N239 644 aa20.72■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.71■□□□□ 0.91
CTIF-205ENST00000587860 MSH5O43196 834 aa20.7■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.69■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 KIF15Q9NS87 1388 aa20.69■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.68■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.67■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 USP47Q96K76 1375 aa20.66■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.65■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.65■□□□□ 0.9
CTIF-205ENST00000587860 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.63■□□□□ 0.89
CTIF-205ENST00000587860 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTIF-205ENST00000587860 ABCA8O94911 1581 aa20.63■□□□□ 0.89
CTIF-205ENST00000587860 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.61■□□□□ 0.89
CTIF-205ENST00000587860 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.6■□□□□ 0.89
CTIF-205ENST00000587860 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.6■□□□□ 0.89
CTIF-205ENST00000587860 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.58■□□□□ 0.89
CTIF-205ENST00000587860 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-205ENST00000587860 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CTIF-205ENST00000587860 ADGRL2O95490 1459 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-205ENST00000587860 MBD5Q9P267 1494 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-205ENST00000587860 AFAP1Q8N556 730 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-205ENST00000587860 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-205ENST00000587860 CHD1O14646 1710 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms