RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	PLA2R1	Q13018	1463 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MSI2-216	ENST00000582772	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MSI2-216	ENST00000582772	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	DISP1	Q96F81	1524 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	9.94	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	9.92	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		9.92	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	IQGAP2	Q13576	1575 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MSI2-216	ENST00000582772	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	PKD2	Q13563	968 aa		9.89	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		9.89	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	9.88	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		9.88	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	FOXD1	Q16676	465 aa		9.87	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	KCNH8	Q96L42	1107 aa		9.87	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		9.87	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	ABCA8	O94911	1581 aa		9.86	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	MLEC	Q14165	292 aa		9.86	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC34A2	O95436	690 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	SYNM	O15061	1565 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	NPAT	Q14207	1427 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	HECW1	Q76N89	1606 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	CEP350	Q5VT06	3117 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MSI2-216	ENST00000582772	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	ATP10A	O60312	1499 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	EP400	Q96L91	3159 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	MROH2A	A6NES4	1674 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	RERE	Q9P2R6	1566 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	AGL	P35573	1532 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MSI2-216	ENST00000582772	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	YY1	P25490	414 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM52	Q96A61	297 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	9.75	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	KDM5C	P41229	1560 aa		9.71	□□□□□ -0.85
MSI2-216	ENST00000582772	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	IGF1R	P08069	1367 aa		9.7	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	9.7	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	RGS12	O14924	1447 aa		9.69	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	RXRB	P28702	533 aa		9.69	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		9.68	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	LRP6	O75581	1613 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	ATP10B	O94823	1461 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	DEPDC5	O75140	1603 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	9.66	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	MED14	O60244	1454 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	JCAD	Q9P266	1359 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MSI2-216	ENST00000582772	NWD1	Q149M9	1564 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	UTRN	P46939	3433 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	PHLPP1	O60346	1717 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	IQGAP1	P46940	1657 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	SHPRH	Q149N8	1683 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	ABCA6	Q8N139	1617 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	C1QTNF8	P60827	252 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC125	Q86Z20	511 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA3	Q08378	1498 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		9.58	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		9.57	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		9.57	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZMYM3	Q14202	1370 aa		9.57	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		9.57	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	KIF14	Q15058	1648 aa		9.56	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	9.56	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	9.55	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	9.55	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	KIF27	Q86VH2	1401 aa		9.55	□□□□□ -0.88
MSI2-216	ENST00000582772	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms