RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 MCCP23508 829 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 CUX2O14529 1486 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 NRDCO43847 1150 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD1Q16676 465 aa27.14■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 SOX12O15370 315 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 PKD2Q13563 968 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP44Q96MT7 982 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 ERCC6Q03468 1493 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 NPHP1O15259 732 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRM-211ENST00000580170 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 DRC7Q8IY82 874 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA2Q08379 1002 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 APBB1O00213 710 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 RALBP1Q15311 655 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRM-211ENST00000580170 ARID3AQ99856 593 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 GBP4Q96PP9 640 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 STK26Q9P289 416 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC8Q09428 1581 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 PTMSP20962 102 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRM-211ENST00000580170 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 MLECQ14165 292 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 GGT6Q6P531 493 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRM-211ENST00000580170 NUP155O75694 1391 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRM-211ENST00000580170 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PTPRM-211ENST00000580170 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-211ENST00000580170 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 FMN1Q68DA7 1419 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRM-211ENST00000580170 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 CLSTN1O94985 981 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 PDE3BQ13370 1112 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP13Q86W25 1043 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRM-211ENST00000580170 STK31Q9BXU1 1019 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRM-211ENST00000580170 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRM-211ENST00000580170 HMMRO75330 724 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRM-211ENST00000580170 GPATCH3Q96I76 525 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.64■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 KIF15Q9NS87 1388 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 TPM4P67936 248 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 30.4
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRM-211ENST00000580170 KIF3BO15066 747 aa26.58■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 GORABQ5T7V8 394 aa26.58■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.58■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.58■■□□□ 1.84
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