RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576677.5

TBCD-222, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 1 (best)

Gene TBCD, Length 1,926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-222	ENST00000576677	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TBCD-222	ENST00000576677	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
TBCD-222	ENST00000576677	KDM6B	O15054	1643 aa		32.01	■■■□□ 2.72
TBCD-222	ENST00000576677	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TBCD-222	ENST00000576677	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TBCD-222	ENST00000576677	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TBCD-222	ENST00000576677	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TBCD-222	ENST00000576677	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TBCD-222	ENST00000576677	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
TBCD-222	ENST00000576677	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.95	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TBCD-222	ENST00000576677	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TBCD-222	ENST00000576677	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TBCD-222	ENST00000576677	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
TBCD-222	ENST00000576677	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TBCD-222	ENST00000576677	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TBCD-222	ENST00000576677	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TBCD-222	ENST00000576677	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TBCD-222	ENST00000576677	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TBCD-222	ENST00000576677	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TBCD-222	ENST00000576677	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TBCD-222	ENST00000576677	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TBCD-222	ENST00000576677	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.76	■■■□□ 2.67	8e-7	■■■■□ 20
TBCD-222	ENST00000576677	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	PLCH2	O75038	1416 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TBCD-222	ENST00000576677	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.7	■■■□□ 2.66
TBCD-222	ENST00000576677	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.7	■■■□□ 2.66
TBCD-222	ENST00000576677	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TBCD-222	ENST00000576677	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TBCD-222	ENST00000576677	PZP	P20742	1482 aa		31.64	■■■□□ 2.66
TBCD-222	ENST00000576677	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.63	■■■□□ 2.65
TBCD-222	ENST00000576677	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
TBCD-222	ENST00000576677	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TBCD-222	ENST00000576677	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TBCD-222	ENST00000576677	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TBCD-222	ENST00000576677	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TBCD-222	ENST00000576677	FOXD1	Q16676	465 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TBCD-222	ENST00000576677	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TBCD-222	ENST00000576677	ABCC1	P33527	1531 aa		31.54	■■■□□ 2.64
TBCD-222	ENST00000576677	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.52	■■■□□ 2.64
TBCD-222	ENST00000576677	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.51	■■■□□ 2.64
TBCD-222	ENST00000576677	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
TBCD-222	ENST00000576677	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TBCD-222	ENST00000576677	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TBCD-222	ENST00000576677	NUP155	O75694	1391 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TBCD-222	ENST00000576677	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	31.43	■■■□□ 2.62
TBCD-222	ENST00000576677	PKD2	Q13563	968 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TBCD-222	ENST00000576677	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TBCD-222	ENST00000576677	FANCA	O15360	1455 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TBCD-222	ENST00000576677	MIER1	Q8N108	512 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TBCD-222	ENST00000576677	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TBCD-222	ENST00000576677	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TBCD-222	ENST00000576677	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TBCD-222	ENST00000576677	UNC13B	O14795	1591 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TBCD-222	ENST00000576677	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TBCD-222	ENST00000576677	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TBCD-222	ENST00000576677	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TBCD-222	ENST00000576677	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TBCD-222	ENST00000576677	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
TBCD-222	ENST00000576677	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.26	■■■□□ 2.6
TBCD-222	ENST00000576677	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TBCD-222	ENST00000576677	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.24	■■■□□ 2.59
TBCD-222	ENST00000576677	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.22	■■■□□ 2.59
TBCD-222	ENST00000576677	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TBCD-222	ENST00000576677	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
TBCD-222	ENST00000576677	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
TBCD-222	ENST00000576677	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TBCD-222	ENST00000576677	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TBCD-222	ENST00000576677	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	31.15	■■■□□ 2.58	1e-6	■■□□□ 13.2
TBCD-222	ENST00000576677	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TBCD-222	ENST00000576677	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TBCD-222	ENST00000576677	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TBCD-222	ENST00000576677	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TBCD-222	ENST00000576677	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TBCD-222	ENST00000576677	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.08	■■■□□ 2.57
TBCD-222	ENST00000576677	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TBCD-222	ENST00000576677	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
TBCD-222	ENST00000576677	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TBCD-222	ENST00000576677	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TBCD-222	ENST00000576677	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TBCD-222	ENST00000576677	DEPDC5	O75140	1603 aa		31.04	■■■□□ 2.56

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