RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576513.2

SLC12A4-218, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SLC12A4, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-218ENST00000576513 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 PLCH2O75038 1416 aa21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 MLECQ14165 292 aa21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 FMN1Q68DA7 1419 aa21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 HSPA2P54652 639 aa21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 HECW1Q76N89 1606 aa21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4-218ENST00000576513 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4-218ENST00000576513 ATP10AO60312 1499 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4-218ENST00000576513 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4-218ENST00000576513 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.96■□□□□ 0.95
SLC12A4-218ENST00000576513 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.95■□□□□ 0.95
SLC12A4-218ENST00000576513 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.94■□□□□ 0.94
SLC12A4-218ENST00000576513 KIF14Q15058 1648 aa20.93■□□□□ 0.94
SLC12A4-218ENST00000576513 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.92■□□□□ 0.94
SLC12A4-218ENST00000576513 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.91■□□□□ 0.94
SLC12A4-218ENST00000576513 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SLC12A4-218ENST00000576513 APLP2Q06481 763 aa20.9■□□□□ 0.94
SLC12A4-218ENST00000576513 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.89■□□□□ 0.94
SLC12A4-218ENST00000576513 CERKQ8TCT0 537 aa20.89■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 AFAP1Q8N556 730 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 MAP3K1Q13233 1512 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SLC12A4-218ENST00000576513 KDM5CP41229 1560 aa20.83■□□□□ 0.92
SLC12A4-218ENST00000576513 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.82■□□□□ 0.92
SLC12A4-218ENST00000576513 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.81■□□□□ 0.92
SLC12A4-218ENST00000576513 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4-218ENST00000576513 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC12A4-218ENST00000576513 REREQ9P2R6 1566 aa20.77■□□□□ 0.92
SLC12A4-218ENST00000576513 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.76■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 PREX2Q70Z35 1606 aa20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 TIAM1Q13009 1591 aa20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCC1P33527 1531 aa20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 AGLP35573 1532 aa20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCA6Q8N139 1617 aa20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4-218ENST00000576513 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 STRCQ7RTU9 1775 aa20.69■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 C3P01024 1663 aa20.69■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.69■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 PTPRTO14522 1441 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.64■□□□□ 0.9
SLC12A4-218ENST00000576513 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 NPATQ14207 1427 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4-218ENST00000576513 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 MROH2AA6NES4 1674 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 ZMYM3Q14202 1370 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 NCOA1Q15788 1441 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 ATP7AQ04656 1500 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-218ENST00000576513 A2MP01023 1474 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 GGT6Q6P531 493 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 PKD2Q13563 968 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 PLXNC1O60486 1568 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4-218ENST00000576513 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 SOCS7O14512 581 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 ILDR2Q71H61 639 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 PLA2R1Q13018 1463 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 PTPRKQ15262 1439 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4-218ENST00000576513 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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