RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 HECW1Q76N89 1606 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS2-204ENST00000571386 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-204ENST00000571386 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-204ENST00000571386 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS2-204ENST00000571386 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SPNS2-204ENST00000571386 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS2-204ENST00000571386 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SPNS2-204ENST00000571386 MLECQ14165 292 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS2-204ENST00000571386 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS2-204ENST00000571386 CERKQ8TCT0 537 aa26.91■■□□□ 1.9
SPNS2-204ENST00000571386 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS2-204ENST00000571386 PLCH2O75038 1416 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS2-204ENST00000571386 CLIP1P30622 1438 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS2-204ENST00000571386 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS2-204ENST00000571386 ATP10AO60312 1499 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS2-204ENST00000571386 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS2-204ENST00000571386 STRCQ7RTU9 1775 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS2-204ENST00000571386 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS2-204ENST00000571386 KIF14Q15058 1648 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS2-204ENST00000571386 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS2-204ENST00000571386 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS2-204ENST00000571386 KDM5CP41229 1560 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 C3P01024 1663 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS2-204ENST00000571386 REREQ9P2R6 1566 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS2-204ENST00000571386 ABCA6Q8N139 1617 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS2-204ENST00000571386 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS2-204ENST00000571386 CEP162Q5TB80 1403 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS2-204ENST00000571386 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS2-204ENST00000571386 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS2-204ENST00000571386 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 ILDR2Q71H61 639 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 AFAP1Q8N556 730 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 PREX2Q70Z35 1606 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 PTPRTO14522 1441 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 ABCC1P33527 1531 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS2-204ENST00000571386 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS2-204ENST00000571386 AGLP35573 1532 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS2-204ENST00000571386 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS2-204ENST00000571386 SOCS7O14512 581 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS2-204ENST00000571386 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS2-204ENST00000571386 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 NCOA1Q15788 1441 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 MROH2AA6NES4 1674 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS2-204ENST00000571386 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS2-204ENST00000571386 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS2-204ENST00000571386 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS2-204ENST00000571386 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SPNS2-204ENST00000571386 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS2-204ENST00000571386 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 NPATQ14207 1427 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS2-204ENST00000571386 TIAM1Q13009 1591 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS2-204ENST00000571386 PLXNC1O60486 1568 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS2-204ENST00000571386 ATP7AQ04656 1500 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-204ENST00000571386 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-204ENST00000571386 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-204ENST00000571386 ZMYM3Q14202 1370 aa26.28■■□□□ 1.8
SPNS2-204ENST00000571386 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS2-204ENST00000571386 PLA2R1Q13018 1463 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SPNS2-204ENST00000571386 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
SPNS2-204ENST00000571386 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS2-204ENST00000571386 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SPNS2-204ENST00000571386 NCOA2Q15596 1464 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS2-204ENST00000571386 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SPNS2-204ENST00000571386 A2MP01023 1474 aa26.2■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 PTPRKQ15262 1439 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 MAP3K1Q13233 1512 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 PKD2Q13563 968 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 APLP2Q06481 763 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SPNS2-204ENST00000571386 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms