RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570989.1

ITGA3-216, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

Gene ITGA3, Length 2,495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-216ENST00000570989 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.34■□□□□ 0.85
ITGA3-216ENST00000570989 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-216ENST00000570989 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-216ENST00000570989 JPH4Q96JJ6 628 aa20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-216ENST00000570989 ARID3CA6NKF2 412 aa20.28■□□□□ 0.84
ITGA3-216ENST00000570989 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.25■□□□□ 0.83
ITGA3-216ENST00000570989 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.25■□□□□ 0.83
ITGA3-216ENST00000570989 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.24■□□□□ 0.83
ITGA3-216ENST00000570989 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ITGA3-216ENST00000570989 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.22■□□□□ 0.83
ITGA3-216ENST00000570989 TONSLQ96HA7 1378 aa20.22■□□□□ 0.83
ITGA3-216ENST00000570989 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.21■□□□□ 0.83
ITGA3-216ENST00000570989 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 PTPRKQ15262 1439 aa20.2■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 MIA2Q96PC5 1412 aa20.17■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 ABCA8O94911 1581 aa20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 UACAQ9BZF9 1416 aa20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 HFM1A2PYH4 1435 aa20.15■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ITGA3-216ENST00000570989 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-216ENST00000570989 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-216ENST00000570989 NAIPQ13075 1403 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGA3-216ENST00000570989 KIF14Q15058 1648 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 PTPRGP23470 1445 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 ATP10BO94823 1461 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 AKNAQ7Z591 1439 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-216ENST00000570989 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC184Q52MB2 194 aa20■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 DAPK1P53355 1430 aa19.99■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.99■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.98■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.97■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.97■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.96■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 ABCC5O15440 1437 aa19.96■□□□□ 0.79
ITGA3-216ENST00000570989 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.95■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.95■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 KDM6BO15054 1643 aa19.93■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 ROCK1Q13464 1354 aa19.92■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 ABCC2Q92887 1545 aa19.9■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.9■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 NCOA1Q15788 1441 aa19.89■□□□□ 0.78
ITGA3-216ENST00000570989 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.88■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.88■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.88■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC7Q96M83 1385 aa19.87■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.85■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.83■□□□□ 0.77
ITGA3-216ENST00000570989 MRS2Q9HD23 443 aa19.82■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 ADGRL2O95490 1459 aa19.81■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 PREX2Q70Z35 1606 aa19.81■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa19.8■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.8■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.79■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.78■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.77■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.77■□□□□ 0.76
ITGA3-216ENST00000570989 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.75■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 SLC24A1O60721 1099 aa19.75■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.75■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.74■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.74■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.74■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.73■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.73■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.73■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.73■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 MBD5Q9P267 1494 aa19.72■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.72■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 FOXD1Q16676 465 aa19.71■□□□□ 0.75
ITGA3-216ENST00000570989 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
ITGA3-216ENST00000570989 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
ITGA3-216ENST00000570989 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.7■□□□□ 0.74
ITGA3-216ENST00000570989 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.69■□□□□ 0.74
ITGA3-216ENST00000570989 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.69■□□□□ 0.74
ITGA3-216ENST00000570989 NBR1Q14596 966 aa19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms