RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569248.5

STUB1-211, Transcript of STIP1 homology and U-box containing protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene STUB1, Length 1,853 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1-211ENST00000569248 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.79■■■■■ 4.44
STUB1-211ENST00000569248 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.78■■■■■ 4.44
STUB1-211ENST00000569248 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.78■■■■■ 4.44
STUB1-211ENST00000569248 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
STUB1-211ENST00000569248 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.74■■■■■ 4.43
STUB1-211ENST00000569248 SIN3AQ96ST3 1273 aa42.71■■■■■ 4.43
STUB1-211ENST00000569248 ABCC2Q92887 1545 aa42.71■■■■■ 4.43
STUB1-211ENST00000569248 NEUROD1Q13562 356 aa42.66■■■■■ 4.42
STUB1-211ENST00000569248 KDM6BO15054 1643 aa42.62■■■■■ 4.41
STUB1-211ENST00000569248 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
STUB1-211ENST00000569248 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.59■■■■■ 4.41
STUB1-211ENST00000569248 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.58■■■■■ 4.41
STUB1-211ENST00000569248 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.55■■■■■ 4.4
STUB1-211ENST00000569248 TRIM52Q96A61 297 aa42.55■■■■■ 4.4
STUB1-211ENST00000569248 ADGRL2O95490 1459 aa42.53■■■■■ 4.4
STUB1-211ENST00000569248 NCOA1Q15788 1441 aa42.49■■■■■ 4.39
STUB1-211ENST00000569248 PREX2Q70Z35 1606 aa42.46■■■■■ 4.39
STUB1-211ENST00000569248 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.44■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.43■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.43■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.43■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 TONSLQ96HA7 1378 aa42.42■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.4■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.39■■■■■ 4.38
STUB1-211ENST00000569248 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.36■■■■■ 4.372e-7■■■■□ 26.2
STUB1-211ENST00000569248 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.33■■■■■ 4.37
STUB1-211ENST00000569248 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.32■■■■■ 4.36
STUB1-211ENST00000569248 TSPY4P0CV99 314 aa42.31■■■■■ 4.36
STUB1-211ENST00000569248 TSPY10P0CW01 314 aa42.31■■■■■ 4.36
STUB1-211ENST00000569248 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.31■■■■■ 4.36
STUB1-211ENST00000569248 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.31■■■■■ 4.36
STUB1-211ENST00000569248 MBD5Q9P267 1494 aa42.29■■■■■ 4.36
STUB1-211ENST00000569248 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.28■■■■■ 4.36
STUB1-211ENST00000569248 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.24■■■■■ 4.354e-6■□□□□ 8.7
STUB1-211ENST00000569248 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.24■■■■■ 4.35
STUB1-211ENST00000569248 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.23■■■■■ 4.35
STUB1-211ENST00000569248 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.21■■■■■ 4.35
STUB1-211ENST00000569248 OSCARQ8IYS5 282 aa42.2■■■■■ 4.35
STUB1-211ENST00000569248 KCNH8Q96L42 1107 aa42.19■■■■■ 4.34
STUB1-211ENST00000569248 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
STUB1-211ENST00000569248 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
STUB1-211ENST00000569248 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.14■■■■■ 4.34
STUB1-211ENST00000569248 PZPP20742 1482 aa42.14■■■■■ 4.34
STUB1-211ENST00000569248 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.13■■■■■ 4.33
STUB1-211ENST00000569248 PLCH2O75038 1416 aa42.11■■■■■ 4.33
STUB1-211ENST00000569248 MIER1Q8N108 512 aa42.11■■■■■ 4.33
STUB1-211ENST00000569248 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.1■■■■■ 4.33
STUB1-211ENST00000569248 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.08■■■■■ 4.33
STUB1-211ENST00000569248 KIF15Q9NS87 1388 aa42.08■■■■■ 4.33
STUB1-211ENST00000569248 FOXD1Q16676 465 aa42.06■■■■■ 4.32
STUB1-211ENST00000569248 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
STUB1-211ENST00000569248 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.02■■■■■ 4.32
STUB1-211ENST00000569248 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.99■■■■■ 4.31
STUB1-211ENST00000569248 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.97■■■■■ 4.31
STUB1-211ENST00000569248 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.97■■■■■ 4.31
STUB1-211ENST00000569248 NUP155O75694 1391 aa41.92■■■■■ 4.3
STUB1-211ENST00000569248 PLXNC1O60486 1568 aa41.9■■■■■ 4.3
STUB1-211ENST00000569248 PKD2Q13563 968 aa41.88■■■■■ 4.3
STUB1-211ENST00000569248 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.88■■■■■ 4.29
STUB1-211ENST00000569248 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.87■■■■■ 4.29
STUB1-211ENST00000569248 ABCC1P33527 1531 aa41.87■■■■■ 4.29
STUB1-211ENST00000569248 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.81■■■■■ 4.28
STUB1-211ENST00000569248 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.81■■■■■ 4.28
STUB1-211ENST00000569248 ASXL2Q76L83 1435 aa41.78■■■■■ 4.28
STUB1-211ENST00000569248 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
STUB1-211ENST00000569248 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.75■■■■■ 4.27
STUB1-211ENST00000569248 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.75■■■■■ 4.27
STUB1-211ENST00000569248 UNC13BO14795 1591 aa41.72■■■■■ 4.27
STUB1-211ENST00000569248 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.7■■■■■ 4.27
STUB1-211ENST00000569248 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.68■■■■■ 4.26
STUB1-211ENST00000569248 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
STUB1-211ENST00000569248 ERBINQ96RT1 1412 aa41.66■■■■■ 4.26
STUB1-211ENST00000569248 FANCAO15360 1455 aa41.66■■■■■ 4.26
STUB1-211ENST00000569248 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.65■■■■■ 4.26
STUB1-211ENST00000569248 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
STUB1-211ENST00000569248 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
STUB1-211ENST00000569248 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP41.58■■■■■ 4.25
STUB1-211ENST00000569248 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.56■■■■■ 4.24
STUB1-211ENST00000569248 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.55■■■■■ 4.24
STUB1-211ENST00000569248 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.53■■■■■ 4.24
STUB1-211ENST00000569248 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
STUB1-211ENST00000569248 AFAP1Q8N556 730 aa41.52■■■■■ 4.24
STUB1-211ENST00000569248 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.52■■■■■ 4.24
STUB1-211ENST00000569248 ADGRL1O94910 1474 aa41.5■■■■■ 4.23
STUB1-211ENST00000569248 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
STUB1-211ENST00000569248 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.231e-6■■□□□ 13.1
STUB1-211ENST00000569248 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.45■■■■■ 4.23
STUB1-211ENST00000569248 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
STUB1-211ENST00000569248 ATP7AQ04656 1500 aa41.42■■■■■ 4.22
STUB1-211ENST00000569248 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.38■■■■■ 4.22
STUB1-211ENST00000569248 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.38■■■■■ 4.21
STUB1-211ENST00000569248 CD109Q6YHK3 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
STUB1-211ENST00000569248 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.35■■■■■ 4.21
STUB1-211ENST00000569248 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.31■■■■■ 4.2
STUB1-211ENST00000569248 ATP10AO60312 1499 aa41.3■■■■■ 4.2
STUB1-211ENST00000569248 PLA2R1Q13018 1463 aa41.29■■■■■ 4.2
STUB1-211ENST00000569248 WASHC2AQ641Q2 1341 aa41.28■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms