RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 MLECQ14165 292 aa28.23■■■□□ 2.11
USP10-211ENST00000564566 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.23■■■□□ 2.11
USP10-211ENST00000564566 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.22■■■□□ 2.11
USP10-211ENST00000564566 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
USP10-211ENST00000564566 PLCH2O75038 1416 aa28.21■■■□□ 2.11
USP10-211ENST00000564566 HSPA2P54652 639 aa28.2■■■□□ 2.1
USP10-211ENST00000564566 FMN1Q68DA7 1419 aa28.19■■■□□ 2.1
USP10-211ENST00000564566 KIF14Q15058 1648 aa28.18■■■□□ 2.1
USP10-211ENST00000564566 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.16■■■□□ 2.1
USP10-211ENST00000564566 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.1■■■□□ 2.09
USP10-211ENST00000564566 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.1■■■□□ 2.09
USP10-211ENST00000564566 ATP10AO60312 1499 aa28.09■■■□□ 2.09
USP10-211ENST00000564566 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.09■■■□□ 2.09
USP10-211ENST00000564566 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
USP10-211ENST00000564566 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.09■■■□□ 2.09
USP10-211ENST00000564566 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.07■■■□□ 2.08
USP10-211ENST00000564566 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
USP10-211ENST00000564566 CLIP1P30622 1438 aa28.05■■■□□ 2.08
USP10-211ENST00000564566 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.04■■■□□ 2.08
USP10-211ENST00000564566 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.03■■■□□ 2.08
USP10-211ENST00000564566 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.02■■■□□ 2.08
USP10-211ENST00000564566 KDM5CP41229 1560 aa28■■■□□ 2.07
USP10-211ENST00000564566 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.98■■■□□ 2.07
USP10-211ENST00000564566 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
USP10-211ENST00000564566 AFAP1Q8N556 730 aa27.97■■■□□ 2.07
USP10-211ENST00000564566 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.97■■■□□ 2.07
USP10-211ENST00000564566 PREX2Q70Z35 1606 aa27.94■■■□□ 2.06
USP10-211ENST00000564566 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.94■■■□□ 2.06
USP10-211ENST00000564566 ABCA6Q8N139 1617 aa27.93■■■□□ 2.06
USP10-211ENST00000564566 CERKQ8TCT0 537 aa27.9■■■□□ 2.06
USP10-211ENST00000564566 ABCC1P33527 1531 aa27.89■■■□□ 2.06
USP10-211ENST00000564566 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.89■■■□□ 2.06
USP10-211ENST00000564566 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.89■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 REREQ9P2R6 1566 aa27.88■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.86■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 C3P01024 1663 aa27.84■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.84■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.84■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.84■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.84■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 STRCQ7RTU9 1775 aa27.83■■■□□ 2.05
USP10-211ENST00000564566 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
USP10-211ENST00000564566 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.78■■■□□ 2.04
USP10-211ENST00000564566 AGLP35573 1532 aa27.77■■■□□ 2.04
USP10-211ENST00000564566 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
USP10-211ENST00000564566 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.75■■■□□ 2.03
USP10-211ENST00000564566 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.74■■■□□ 2.03
USP10-211ENST00000564566 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
USP10-211ENST00000564566 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.72■■■□□ 2.03
USP10-211ENST00000564566 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.71■■■□□ 2.03
USP10-211ENST00000564566 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
USP10-211ENST00000564566 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.66■■■□□ 2.02
USP10-211ENST00000564566 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
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USP10-211ENST00000564566 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
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USP10-211ENST00000564566 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.56■■■□□ 2
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USP10-211ENST00000564566 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.54■■■□□ 2
USP10-211ENST00000564566 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
USP10-211ENST00000564566 PLXNC1O60486 1568 aa27.53■■■□□ 2
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USP10-211ENST00000564566 A2MP01023 1474 aa27.51■■■□□ 2
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USP10-211ENST00000564566 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.46■■□□□ 1.99
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USP10-211ENST00000564566 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.43■■□□□ 1.98
USP10-211ENST00000564566 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
USP10-211ENST00000564566 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.42■■□□□ 1.98
USP10-211ENST00000564566 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.42■■□□□ 1.98
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USP10-211ENST00000564566 PTPRKQ15262 1439 aa27.4■■□□□ 1.98
USP10-211ENST00000564566 ILDR2Q71H61 639 aa27.39■■□□□ 1.98
USP10-211ENST00000564566 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
USP10-211ENST00000564566 PLA2R1Q13018 1463 aa27.36■■□□□ 1.97
USP10-211ENST00000564566 MBD5Q9P267 1494 aa27.33■■□□□ 1.97
USP10-211ENST00000564566 PKD2Q13563 968 aa27.31■■□□□ 1.96
USP10-211ENST00000564566 CEP162Q5TB80 1403 aa27.31■■□□□ 1.96
USP10-211ENST00000564566 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
USP10-211ENST00000564566 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.28■■□□□ 1.96
USP10-211ENST00000564566 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.27■■□□□ 1.96
USP10-211ENST00000564566 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.27■■□□□ 1.96
USP10-211ENST00000564566 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
USP10-211ENST00000564566 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.26■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.25■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.25■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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