RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 STK25O00506 426 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-210ENST00000561408 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-210ENST00000561408 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-210ENST00000561408 G3V3G9 751 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 SOX12O15370 315 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 ARHGEF11O15085 1522 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 HMGXB3Q12766 1538 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-210ENST00000561408 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 WDR62O43379 1518 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 POTEMA6NI47 508 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 NLRP6P59044 892 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 POTEGQ6S5H5 508 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 MFRPQ9BY79 579 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 SNPHO15079 494 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 MICALL2Q8IY33 904 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TMOD3-210ENST00000561408 ST18O60284 1047 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD3-210ENST00000561408 SMARCA4P51532 1647 aa9.38□□□□□ -0.91
TMOD3-210ENST00000561408 ARAP1Q96P48 1450 aa9.38□□□□□ -0.91
TMOD3-210ENST00000561408 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-210ENST00000561408 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-210ENST00000561408 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD3-210ENST00000561408 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-210ENST00000561408 PPP1R37O75864 691 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-210ENST00000561408 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 MARVELD3Q96A59 401 aa9.27□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.27□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 CHD1O14646 1710 aa9.27□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 DOK7Q18PE1 504 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 EMP3P54852 163 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD3-210ENST00000561408 C2orf72A6NCS6 295 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-210ENST00000561408 RIMBP2O15034 1052 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-210ENST00000561408 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-210ENST00000561408 KIF3CO14782 793 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-210ENST00000561408 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-210ENST00000561408 TMC2Q8TDI7 906 aa9.19□□□□□ -0.94
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TMOD3-210ENST00000561408 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.15□□□□□ -0.94
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TMOD3-210ENST00000561408 POTEB3A0JP26 581 aa9.13□□□□□ -0.95
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TMOD3-210ENST00000561408 POTEBQ6S5H4 581 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-210ENST00000561408 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-210ENST00000561408 ARSIQ5FYB1 569 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-210ENST00000561408 ERBB3P21860 1342 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-210ENST00000561408 IFT140Q96RY7 1462 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-210ENST00000561408 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
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TMOD3-210ENST00000561408 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 SLC34A2O95436 690 aa9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 FOXK1P85037 733 aa9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 PLPP6Q8IY26 295 aa9.06□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 CFTRP13569 1480 aa9.06□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 WIZO95785 1651 aa9.06□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 DSG2Q14126 1118 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 NUDT7P0C024 238 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 PDE4AP27815 886 aa9.01□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.01□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 FBXO41Q8TF61 875 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 LMTK3Q96Q04 1460 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 TOPBP1Q92547 1522 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 PRDM2Q13029 1718 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.99□□□□□ -0.97
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