RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558930.1

ADAMTS17-204, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 4

Gene ADAMTS17, Length 220 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-204ENST00000558930 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.05■■■■□ 3.36
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ADAMTS17-204ENST00000558930 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.02■■■■□ 3.36
ADAMTS17-204ENST00000558930 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.01■■■■□ 3.36
ADAMTS17-204ENST00000558930 MLECQ14165 292 aa36■■■■□ 3.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 CERKQ8TCT0 537 aa36■■■■□ 3.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.97■■■■□ 3.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.96■■■■□ 3.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.95■■■■□ 3.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 FMN1Q68DA7 1419 aa35.95■■■■□ 3.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.92■■■■□ 3.34
ADAMTS17-204ENST00000558930 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
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ADAMTS17-204ENST00000558930 KIF14Q15058 1648 aa35.86■■■■□ 3.33
ADAMTS17-204ENST00000558930 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 REREQ9P2R6 1566 aa35.81■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.81■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.81■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.79■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 CLIP1P30622 1438 aa35.77■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.77■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
ADAMTS17-204ENST00000558930 STRCQ7RTU9 1775 aa35.76■■■■□ 3.31
ADAMTS17-204ENST00000558930 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.75■■■■□ 3.31
ADAMTS17-204ENST00000558930 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ADAMTS17-204ENST00000558930 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
ADAMTS17-204ENST00000558930 AFAP1Q8N556 730 aa35.73■■■■□ 3.31
ADAMTS17-204ENST00000558930 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.72■■■■□ 3.31
ADAMTS17-204ENST00000558930 AGLP35573 1532 aa35.67■■■■□ 3.3
ADAMTS17-204ENST00000558930 ABCA6Q8N139 1617 aa35.66■■■■□ 3.3
ADAMTS17-204ENST00000558930 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.65■■■■□ 3.3
ADAMTS17-204ENST00000558930 PTPRTO14522 1441 aa35.64■■■■□ 3.3
ADAMTS17-204ENST00000558930 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.63■■■■□ 3.29
ADAMTS17-204ENST00000558930 C3P01024 1663 aa35.62■■■■□ 3.29
ADAMTS17-204ENST00000558930 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.62■■■■□ 3.29
ADAMTS17-204ENST00000558930 PREX2Q70Z35 1606 aa35.61■■■■□ 3.29
ADAMTS17-204ENST00000558930 ABCC1P33527 1531 aa35.61■■■■□ 3.29
ADAMTS17-204ENST00000558930 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.56■■■■□ 3.28
ADAMTS17-204ENST00000558930 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.55■■■■□ 3.28
ADAMTS17-204ENST00000558930 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.54■■■■□ 3.28
ADAMTS17-204ENST00000558930 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.54■■■■□ 3.28
ADAMTS17-204ENST00000558930 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.52■■■■□ 3.28
ADAMTS17-204ENST00000558930 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
ADAMTS17-204ENST00000558930 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.51■■■■□ 3.27
ADAMTS17-204ENST00000558930 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.49■■■■□ 3.27
ADAMTS17-204ENST00000558930 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.49■■■■□ 3.27
ADAMTS17-204ENST00000558930 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.48■■■■□ 3.27
ADAMTS17-204ENST00000558930 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.46■■■■□ 3.27
ADAMTS17-204ENST00000558930 NCOA1Q15788 1441 aa35.45■■■■□ 3.27
ADAMTS17-204ENST00000558930 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.42■■■■□ 3.26
ADAMTS17-204ENST00000558930 MROH2AA6NES4 1674 aa35.42■■■■□ 3.26
ADAMTS17-204ENST00000558930 NPATQ14207 1427 aa35.41■■■■□ 3.26
ADAMTS17-204ENST00000558930 ILDR2Q71H61 639 aa35.41■■■■□ 3.26
ADAMTS17-204ENST00000558930 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.38■■■■□ 3.25
ADAMTS17-204ENST00000558930 SOCS7O14512 581 aa35.38■■■■□ 3.25
ADAMTS17-204ENST00000558930 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.34■■■■□ 3.25
ADAMTS17-204ENST00000558930 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.33■■■■□ 3.25
ADAMTS17-204ENST00000558930 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.31■■■■□ 3.24
ADAMTS17-204ENST00000558930 ZMYM3Q14202 1370 aa35.28■■■■□ 3.24
ADAMTS17-204ENST00000558930 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.28■■■■□ 3.24
ADAMTS17-204ENST00000558930 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ADAMTS17-204ENST00000558930 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.26■■■■□ 3.24
ADAMTS17-204ENST00000558930 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.24■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 PLXNC1O60486 1568 aa35.24■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 ATP7AQ04656 1500 aa35.22■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.22■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 PLA2R1Q13018 1463 aa35.21■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.17■■■■□ 3.22
ADAMTS17-204ENST00000558930 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
ADAMTS17-204ENST00000558930 A2MP01023 1474 aa35.16■■■■□ 3.22
ADAMTS17-204ENST00000558930 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
ADAMTS17-204ENST00000558930 PKD2Q13563 968 aa35.15■■■■□ 3.22
ADAMTS17-204ENST00000558930 PTPRKQ15262 1439 aa35.14■■■■□ 3.22
ADAMTS17-204ENST00000558930 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
ADAMTS17-204ENST00000558930 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
ADAMTS17-204ENST00000558930 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.12■■■■□ 3.21
ADAMTS17-204ENST00000558930 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.11■■■■□ 3.21
ADAMTS17-204ENST00000558930 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
ADAMTS17-204ENST00000558930 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
ADAMTS17-204ENST00000558930 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.06■■■■□ 3.2
ADAMTS17-204ENST00000558930 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.05■■■■□ 3.2
ADAMTS17-204ENST00000558930 GGT6Q6P531 493 aa35.02■■■■□ 3.2
ADAMTS17-204ENST00000558930 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.01■■■■□ 3.2
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ADAMTS17-204ENST00000558930 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.97■■■■□ 3.19
ADAMTS17-204ENST00000558930 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.95■■■■□ 3.19
ADAMTS17-204ENST00000558930 MBD5Q9P267 1494 aa34.94■■■■□ 3.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 TIAM1Q13009 1591 aa34.91■■■■□ 3.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.89■■■■□ 3.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
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ADAMTS17-204ENST00000558930 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
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