RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.1■■■□□ 2.09
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.07■■■□□ 2.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.07■■■□□ 2.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP170Q5SW79 1584 aa28.06■■■□□ 2.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCANQ96GW7 911 aa28.06■■■□□ 2.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 ROCK1Q13464 1354 aa28.05■■■□□ 2.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 FKBP8Q14318 412 aa28.01■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYNJ2O15056 1496 aa27.98■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF14Q15058 1648 aa27.96■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.96■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.96■■■□□ 2.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 JPH4Q96JJ6 628 aa27.94■■■□□ 2.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.9■■■□□ 2.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCOA1Q15788 1441 aa27.87■■■□□ 2.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.87■■■□□ 2.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 PZPP20742 1482 aa27.86■■■□□ 2.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP160Q12769 1436 aa27.86■■■□□ 2.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.86■■■□□ 2.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.85■■■□□ 2.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC184Q52MB2 194 aa27.82■■■□□ 2.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.81■■■□□ 2.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.81■■■□□ 2.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC7Q96M83 1385 aa27.81■■■□□ 2.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEFLP07196 543 aa27.79■■■□□ 2.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.79■■■□□ 2.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.76■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.76■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PKD2Q13563 968 aa27.75■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRL2O95490 1459 aa27.74■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP10BO94823 1461 aa27.74■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.73■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.72■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCA8O94911 1581 aa27.72■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.72■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.72■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.71■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.7■■■□□ 2.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.68■■■□□ 2.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.64■■■□□ 2.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MBD5Q9P267 1494 aa27.63■■■□□ 2.01
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AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.63■■■□□ 2.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP155O75694 1391 aa27.62■■■□□ 2.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MRS2Q9HD23 443 aa27.6■■■□□ 2.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.59■■■□□ 2.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPY4P0CV99 314 aa27.57■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPY10P0CW01 314 aa27.57■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP47Q96K76 1375 aa27.57■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPRGP23470 1445 aa27.56■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.55■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.55■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF15Q9NS87 1388 aa27.53■■■□□ 2
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.49■■□□□ 1.99
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM5CP41229 1560 aa27.47■■□□□ 1.99
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.45■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.45■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.42■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.42■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.42■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.41■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.4■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHD1O14646 1710 aa27.4■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.4■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.39■■□□□ 1.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.39■■□□□ 1.97
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AFG3L1P-217ENST00000557444 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.35■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYT1Q01538 1121 aa27.35■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.34■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.34■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.34■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.33■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.33■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.33■■□□□ 1.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.969e-7■■□□□ 14.3
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.3■■□□□ 1.96
AFG3L1P-217ENST00000557444 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
AFG3L1P-217ENST00000557444 RGL3Q3MIN7 710 aa27.27■■□□□ 1.96
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