RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.12■■■□□ 2.73
FOXN3-211ENST00000555855 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.12■■■□□ 2.73
FOXN3-211ENST00000555855 FMN1Q68DA7 1419 aa32.11■■■□□ 2.73
FOXN3-211ENST00000555855 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.11■■■□□ 2.73
FOXN3-211ENST00000555855 HSPA2P54652 639 aa32.06■■■□□ 2.72
FOXN3-211ENST00000555855 HECW1Q76N89 1606 aa32.06■■■□□ 2.72
FOXN3-211ENST00000555855 ATP10AO60312 1499 aa32■■■□□ 2.71
FOXN3-211ENST00000555855 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.98■■■□□ 2.71
FOXN3-211ENST00000555855 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.98■■■□□ 2.71
FOXN3-211ENST00000555855 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.95■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.95■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 CLIP1P30622 1438 aa31.92■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.92■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.92■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.91■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 AFAP1Q8N556 730 aa31.91■■■□□ 2.7
FOXN3-211ENST00000555855 KIF14Q15058 1648 aa31.88■■■□□ 2.69
FOXN3-211ENST00000555855 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.87■■■□□ 2.69
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.87■■■□□ 2.69
FOXN3-211ENST00000555855 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
FOXN3-211ENST00000555855 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.85■■■□□ 2.69
FOXN3-211ENST00000555855 CERKQ8TCT0 537 aa31.83■■■□□ 2.69
FOXN3-211ENST00000555855 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.77■■■□□ 2.68
FOXN3-211ENST00000555855 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
FOXN3-211ENST00000555855 KDM5CP41229 1560 aa31.74■■■□□ 2.67
FOXN3-211ENST00000555855 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
FOXN3-211ENST00000555855 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.72■■■□□ 2.67
FOXN3-211ENST00000555855 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.7■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.69■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.69■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.69■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.69■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.67■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.66■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXN3-211ENST00000555855 REREQ9P2R6 1566 aa31.64■■■□□ 2.65
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
FOXN3-211ENST00000555855 PREX2Q70Z35 1606 aa31.6■■■□□ 2.65
FOXN3-211ENST00000555855 ABCA6Q8N139 1617 aa31.58■■■□□ 2.65
FOXN3-211ENST00000555855 ABCC1P33527 1531 aa31.58■■■□□ 2.65
FOXN3-211ENST00000555855 AGLP35573 1532 aa31.58■■■□□ 2.65
FOXN3-211ENST00000555855 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.54■■■□□ 2.64
FOXN3-211ENST00000555855 STRCQ7RTU9 1775 aa31.53■■■□□ 2.64
FOXN3-211ENST00000555855 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.51■■■□□ 2.64
FOXN3-211ENST00000555855 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.51■■■□□ 2.63
FOXN3-211ENST00000555855 C3P01024 1663 aa31.51■■■□□ 2.63
FOXN3-211ENST00000555855 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.5■■■□□ 2.63
FOXN3-211ENST00000555855 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.631e-6■■■■□ 19.9
FOXN3-211ENST00000555855 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
FOXN3-211ENST00000555855 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.49■■■□□ 2.63
FOXN3-211ENST00000555855 PTPRTO14522 1441 aa31.47■■■□□ 2.63
FOXN3-211ENST00000555855 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
FOXN3-211ENST00000555855 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
FOXN3-211ENST00000555855 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.43■■■□□ 2.62
FOXN3-211ENST00000555855 ZMYM3Q14202 1370 aa31.4■■■□□ 2.62
FOXN3-211ENST00000555855 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.39■■■□□ 2.62
FOXN3-211ENST00000555855 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.38■■■□□ 2.61
FOXN3-211ENST00000555855 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.37■■■□□ 2.61
FOXN3-211ENST00000555855 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.37■■■□□ 2.61
FOXN3-211ENST00000555855 NPATQ14207 1427 aa31.35■■■□□ 2.61
FOXN3-211ENST00000555855 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.34■■■□□ 2.61
FOXN3-211ENST00000555855 GGT6Q6P531 493 aa31.33■■■□□ 2.61
FOXN3-211ENST00000555855 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
FOXN3-211ENST00000555855 NCOA1Q15788 1441 aa31.32■■■□□ 2.6
FOXN3-211ENST00000555855 ATP7AQ04656 1500 aa31.29■■■□□ 2.6
FOXN3-211ENST00000555855 MROH2AA6NES4 1674 aa31.29■■■□□ 2.6
FOXN3-211ENST00000555855 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.29■■■□□ 2.6
FOXN3-211ENST00000555855 A2MP01023 1474 aa31.28■■■□□ 2.6
FOXN3-211ENST00000555855 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.28■■■□□ 2.6
FOXN3-211ENST00000555855 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.25■■■□□ 2.59
FOXN3-211ENST00000555855 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.24■■■□□ 2.59
FOXN3-211ENST00000555855 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.22■■■□□ 2.59
FOXN3-211ENST00000555855 PKD2Q13563 968 aa31.21■■■□□ 2.59
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
FOXN3-211ENST00000555855 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
FOXN3-211ENST00000555855 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
FOXN3-211ENST00000555855 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.19■■■□□ 2.58
FOXN3-211ENST00000555855 PLXNC1O60486 1568 aa31.17■■■□□ 2.58
FOXN3-211ENST00000555855 PTPRKQ15262 1439 aa31.16■■■□□ 2.58
FOXN3-211ENST00000555855 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.13■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 ILDR2Q71H61 639 aa31.12■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.12■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 PLA2R1Q13018 1463 aa31.1■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.09■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 MBD5Q9P267 1494 aa31.09■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.09■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 TIAM1Q13009 1591 aa31.09■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 CEP162Q5TB80 1403 aa31.07■■■□□ 2.57
FOXN3-211ENST00000555855 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.07■■■□□ 2.56
FOXN3-211ENST00000555855 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.07■■■□□ 2.56
FOXN3-211ENST00000555855 KIF3BO15066 747 aa31.07■■■□□ 2.56
FOXN3-211ENST00000555855 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
FOXN3-211ENST00000555855 SOCS7O14512 581 aa31.05■■■□□ 2.56
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
FOXN3-211ENST00000555855 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
FOXN3-211ENST00000555855 A2ML1A8K2U0 1454 aa31■■■□□ 2.55
FOXN3-211ENST00000555855 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms