RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554426.5

CKB-208, Transcript of creatine kinase B, human

TSL 5

Gene CKB, Length 775 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CKB-208	ENST00000554426	MLEC	Q14165	292 aa		44	■■■■■ 4.63
CKB-208	ENST00000554426	ATP10A	O60312	1499 aa		43.86	■■■■■ 4.61
CKB-208	ENST00000554426	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.85	■■■■■ 4.61
CKB-208	ENST00000554426	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.85	■■■■■ 4.61
CKB-208	ENST00000554426	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	43.84	■■■■■ 4.61
CKB-208	ENST00000554426	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.83	■■■■■ 4.61
CKB-208	ENST00000554426	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.83	■■■■■ 4.61
CKB-208	ENST00000554426	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.81	■■■■■ 4.6
CKB-208	ENST00000554426	FMN1	Q68DA7	1419 aa		43.81	■■■■■ 4.6
CKB-208	ENST00000554426	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.8	■■■■■ 4.6
CKB-208	ENST00000554426	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	43.77	■■■■■ 4.6
CKB-208	ENST00000554426	KIF14	Q15058	1648 aa		43.77	■■■■■ 4.6
CKB-208	ENST00000554426	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.75	■■■■■ 4.59
CKB-208	ENST00000554426	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.74	■■■■■ 4.59
CKB-208	ENST00000554426	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.72	■■■■■ 4.59
CKB-208	ENST00000554426	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	43.7	■■■■■ 4.59
CKB-208	ENST00000554426	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.69	■■■■■ 4.58
CKB-208	ENST00000554426	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	43.68	■■■■■ 4.58
CKB-208	ENST00000554426	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.67	■■■■■ 4.58
CKB-208	ENST00000554426	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.63	■■■■■ 4.58
CKB-208	ENST00000554426	KDM5C	P41229	1560 aa		43.63	■■■■■ 4.58
CKB-208	ENST00000554426	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.6	■■■■■ 4.57
CKB-208	ENST00000554426	CLIP1	P30622	1438 aa		43.55	■■■■■ 4.56
CKB-208	ENST00000554426	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.54	■■■■■ 4.56
CKB-208	ENST00000554426	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.53	■■■■■ 4.56
CKB-208	ENST00000554426	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.48	■■■■■ 4.55
CKB-208	ENST00000554426	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.46	■■■■■ 4.55
CKB-208	ENST00000554426	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.46	■■■■■ 4.55
CKB-208	ENST00000554426	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.45	■■■■■ 4.55
CKB-208	ENST00000554426	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.45	■■■■■ 4.55
CKB-208	ENST00000554426	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.45	■■■■■ 4.55
CKB-208	ENST00000554426	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.45	■■■■■ 4.55
CKB-208	ENST00000554426	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.44	■■■■■ 4.54
CKB-208	ENST00000554426	ABCC1	P33527	1531 aa		43.38	■■■■■ 4.54
CKB-208	ENST00000554426	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.38	■■■■■ 4.53
CKB-208	ENST00000554426	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.38	■■■■■ 4.53
CKB-208	ENST00000554426	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.36	■■■■■ 4.53
CKB-208	ENST00000554426	AGL	P35573	1532 aa		43.35	■■■■■ 4.53
CKB-208	ENST00000554426	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.32	■■■■■ 4.53
CKB-208	ENST00000554426	C3	P01024	1663 aa		43.32	■■■■■ 4.53
CKB-208	ENST00000554426	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.52
CKB-208	ENST00000554426	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.27	■■■■■ 4.52
CKB-208	ENST00000554426	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.27	■■■■■ 4.52
CKB-208	ENST00000554426	PTPRT	O14522	1441 aa		43.24	■■■■■ 4.51
CKB-208	ENST00000554426	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.24	■■■■■ 4.51
CKB-208	ENST00000554426	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
CKB-208	ENST00000554426	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.17	■■■■■ 4.5
CKB-208	ENST00000554426	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		43.14	■■■■■ 4.5
CKB-208	ENST00000554426	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.12	■■■■■ 4.49
CKB-208	ENST00000554426	NCOA1	Q15788	1441 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CKB-208	ENST00000554426	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		43.1	■■■■■ 4.49
CKB-208	ENST00000554426	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		43.09	■■■■■ 4.49
CKB-208	ENST00000554426	ILDR2	Q71H61	639 aa		43.09	■■■■■ 4.49
CKB-208	ENST00000554426	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
CKB-208	ENST00000554426	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.07	■■■■■ 4.49
CKB-208	ENST00000554426	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
CKB-208	ENST00000554426	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.05	■■■■■ 4.48
CKB-208	ENST00000554426	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.03	■■■■■ 4.48
CKB-208	ENST00000554426	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
CKB-208	ENST00000554426	NPAT	Q14207	1427 aa		43.01	■■■■■ 4.48
CKB-208	ENST00000554426	ZMYM3	Q14202	1370 aa		43	■■■■■ 4.47
CKB-208	ENST00000554426	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CKB-208	ENST00000554426	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CKB-208	ENST00000554426	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.91	■■■■■ 4.46
CKB-208	ENST00000554426	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.91	■■■■■ 4.46
CKB-208	ENST00000554426	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
CKB-208	ENST00000554426	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.89	■■■■■ 4.46
CKB-208	ENST00000554426	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.89	■■■■■ 4.46
CKB-208	ENST00000554426	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.88	■■■■■ 4.45
CKB-208	ENST00000554426	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
CKB-208	ENST00000554426	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
CKB-208	ENST00000554426	A2M	P01023	1474 aa		42.86	■■■■■ 4.45
CKB-208	ENST00000554426	SOCS7	O14512	581 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CKB-208	ENST00000554426	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CKB-208	ENST00000554426	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.44
CKB-208	ENST00000554426	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CKB-208	ENST00000554426	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CKB-208	ENST00000554426	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CKB-208	ENST00000554426	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
CKB-208	ENST00000554426	GGT6	Q6P531	493 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CKB-208	ENST00000554426	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CKB-208	ENST00000554426	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
CKB-208	ENST00000554426	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
CKB-208	ENST00000554426	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.73	■■■■■ 4.43
CKB-208	ENST00000554426	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CKB-208	ENST00000554426	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
CKB-208	ENST00000554426	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CKB-208	ENST00000554426	PKD2	Q13563	968 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CKB-208	ENST00000554426	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CKB-208	ENST00000554426	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.63	■■■■■ 4.41
CKB-208	ENST00000554426	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CKB-208	ENST00000554426	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CKB-208	ENST00000554426	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CKB-208	ENST00000554426	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CKB-208	ENST00000554426	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CKB-208	ENST00000554426	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
CKB-208	ENST00000554426	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.51	■■■■■ 4.39
CKB-208	ENST00000554426	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
CKB-208	ENST00000554426	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CKB-208	ENST00000554426	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms