RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 KIAA0556O60303 1618 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-211ENST00000552253 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-211ENST00000552253 IFT140Q96RY7 1462 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-211ENST00000552253 ABCC5O15440 1437 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-211ENST00000552253 ROCK1Q13464 1354 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-211ENST00000552253 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-211ENST00000552253 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-211ENST00000552253 DAPK1P53355 1430 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 ARID3CA6NKF2 412 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 FKBP8Q14318 412 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 TRIM52Q96A61 297 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 GRIN2AQ12879 1464 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 NCOA1Q15788 1441 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 BCANQ96GW7 911 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC184Q52MB2 194 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 PZPP20742 1482 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC7Q96M83 1385 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-211ENST00000552253 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 CEP170Q5SW79 1584 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 KIF14Q15058 1648 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 ADGRL2O95490 1459 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 MBD5Q9P267 1494 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 NUP160Q12769 1436 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 SYNJ2O15056 1496 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 NEFLP07196 543 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-211ENST00000552253 ABCA8O94911 1581 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 JPH4Q96JJ6 628 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ATP10BO94823 1461 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 PKD2Q13563 968 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 KDM5CP41229 1560 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 SLC24A1O60721 1099 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ERCC6Q03468 1493 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 PTPRGP23470 1445 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 MRS2Q9HD23 443 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 USP47Q96K76 1375 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 FBLN2P98095 1184 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-211ENST00000552253 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 NUP155O75694 1391 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 MSH5O43196 834 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 KIF15Q9NS87 1388 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-211ENST00000552253 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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