RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.06■□□□□ 0.64
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CS-221ENST00000550734 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19■□□□□ 0.63
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CS-221ENST00000550734 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19■□□□□ 0.63
CS-221ENST00000550734 CERKQ8TCT0 537 aa18.99■□□□□ 0.63
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CS-221ENST00000550734 ILDR2Q71H61 639 aa18.69■□□□□ 0.58
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CS-221ENST00000550734 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.62■□□□□ 0.57
CS-221ENST00000550734 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CS-221ENST00000550734 PLXNC1O60486 1568 aa18.61■□□□□ 0.57
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CS-221ENST00000550734 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
CS-221ENST00000550734 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.59■□□□□ 0.57
CS-221ENST00000550734 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CS-221ENST00000550734 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CS-221ENST00000550734 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.58■□□□□ 0.57
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CS-221ENST00000550734 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 PTPRKQ15262 1439 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 PKD2Q13563 968 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
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CS-221ENST00000550734 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-221ENST00000550734 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.52■□□□□ 0.55
CS-221ENST00000550734 CEP162Q5TB80 1403 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-221ENST00000550734 GGT6Q6P531 493 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-221ENST00000550734 MBD5Q9P267 1494 aa18.48■□□□□ 0.55
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CS-221ENST00000550734 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.46■□□□□ 0.55
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CS-221ENST00000550734 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.46■□□□□ 0.54
CS-221ENST00000550734 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-221ENST00000550734 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-221ENST00000550734 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-221ENST00000550734 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-221ENST00000550734 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.41■□□□□ 0.54
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