RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550404.1

ANKRD13A-206, Transcript of ankyrin repeat domain 13A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD13A, Length 2,350 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13A-206ENST00000550404 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.34■■■□□ 2.29
ANKRD13A-206ENST00000550404 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.32■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.32■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 MRS2Q9HD23 443 aa29.3■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.29■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.29■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.27■■■□□ 2.28
ANKRD13A-206ENST00000550404 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.26■■■□□ 2.27
ANKRD13A-206ENST00000550404 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
ANKRD13A-206ENST00000550404 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD13A-206ENST00000550404 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD13A-206ENST00000550404 ROCK1Q13464 1354 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD13A-206ENST00000550404 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.2■■■□□ 2.27
ANKRD13A-206ENST00000550404 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ANKRD13A-206ENST00000550404 ERCC6Q03468 1493 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD13A-206ENST00000550404 FOXD1Q16676 465 aa29.16■■■□□ 2.26
ANKRD13A-206ENST00000550404 WDR62O43379 1518 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD13A-206ENST00000550404 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD13A-206ENST00000550404 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
ANKRD13A-206ENST00000550404 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
ANKRD13A-206ENST00000550404 DAPK1P53355 1430 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD13A-206ENST00000550404 IQGAP2Q13576 1575 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD13A-206ENST00000550404 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD13A-206ENST00000550404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ANKRD13A-206ENST00000550404 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ANKRD13A-206ENST00000550404 ABCC5O15440 1437 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD13A-206ENST00000550404 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
ANKRD13A-206ENST00000550404 MBD5Q9P267 1494 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD13A-206ENST00000550404 PBRM1Q86U86 1689 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD13A-206ENST00000550404 NUDCQ9Y266 331 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD13A-206ENST00000550404 DEKP35659 375 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ANKRD13A-206ENST00000550404 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD13A-206ENST00000550404 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ANKRD13A-206ENST00000550404 PZPP20742 1482 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD13A-206ENST00000550404 ADAMTS12P58397 1594 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD13A-206ENST00000550404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
ANKRD13A-206ENST00000550404 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
ANKRD13A-206ENST00000550404 KIF14Q15058 1648 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD13A-206ENST00000550404 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
ANKRD13A-206ENST00000550404 KDM5CP41229 1560 aa28.92■■■□□ 2.22
ANKRD13A-206ENST00000550404 USP47Q96K76 1375 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD13A-206ENST00000550404 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD13A-206ENST00000550404 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD13A-206ENST00000550404 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ANKRD13A-206ENST00000550404 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ANKRD13A-206ENST00000550404 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD13A-206ENST00000550404 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
ANKRD13A-206ENST00000550404 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ANKRD13A-206ENST00000550404 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ANKRD13A-206ENST00000550404 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 ARID3CA6NKF2 412 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 KIAA0556O60303 1618 aa28.8■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.8■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 ADGRL2O95490 1459 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 NBR1Q14596 966 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 DISP1Q96F81 1524 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.76■■■□□ 2.2
ANKRD13A-206ENST00000550404 IFT140Q96RY7 1462 aa28.75■■■□□ 2.19
ANKRD13A-206ENST00000550404 KIF15Q9NS87 1388 aa28.72■■■□□ 2.19
ANKRD13A-206ENST00000550404 TMC1Q8TDI8 760 aa28.72■■■□□ 2.19
ANKRD13A-206ENST00000550404 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ANKRD13A-206ENST00000550404 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.7■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 E9PCH4 1651 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 PKD2Q13563 968 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ANKRD13A-206ENST00000550404 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 RALBP1Q15311 655 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
ANKRD13A-206ENST00000550404 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.57■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.57■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 FBLN2P98095 1184 aa28.56■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 CEP170Q5SW79 1584 aa28.54■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.52■■■□□ 2.16
ANKRD13A-206ENST00000550404 PDE3BQ13370 1112 aa28.51■■■□□ 2.15
ANKRD13A-206ENST00000550404 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms