RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547217.5

PACS2-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PACS2, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-205ENST00000547217 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.43■■□□□ 1.66
PACS2-205ENST00000547217 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PACS2-205ENST00000547217 KCNH8Q96L42 1107 aa25.4■■□□□ 1.66
PACS2-205ENST00000547217 NEUROD1Q13562 356 aa25.39■■□□□ 1.66
PACS2-205ENST00000547217 KDM6BO15054 1643 aa25.39■■□□□ 1.66
PACS2-205ENST00000547217 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.37■■□□□ 1.65
PACS2-205ENST00000547217 AKNAQ7Z591 1439 aa25.34■■□□□ 1.65
PACS2-205ENST00000547217 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PACS2-205ENST00000547217 TRIM52Q96A61 297 aa25.34■■□□□ 1.65
PACS2-205ENST00000547217 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PACS2-205ENST00000547217 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.33■■□□□ 1.65
PACS2-205ENST00000547217 ROCK1Q13464 1354 aa25.32■■□□□ 1.64
PACS2-205ENST00000547217 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.642e-7■■■■□ 26.4
PACS2-205ENST00000547217 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.3■■□□□ 1.64
PACS2-205ENST00000547217 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.29■■□□□ 1.64
PACS2-205ENST00000547217 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
PACS2-205ENST00000547217 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.29■■□□□ 1.64
PACS2-205ENST00000547217 NCOA1Q15788 1441 aa25.25■■□□□ 1.63
PACS2-205ENST00000547217 PREX2Q70Z35 1606 aa25.24■■□□□ 1.63
PACS2-205ENST00000547217 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.23■■□□□ 1.63
PACS2-205ENST00000547217 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PACS2-205ENST00000547217 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.22■■□□□ 1.63
PACS2-205ENST00000547217 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.2■■□□□ 1.63
PACS2-205ENST00000547217 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.2■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 TSPY4P0CV99 314 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 TSPY10P0CW01 314 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 MBD5Q9P267 1494 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 FOXD1Q16676 465 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 ADGRL2O95490 1459 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-205ENST00000547217 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.11■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.1■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 PLCH2O75038 1416 aa25.1■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.09■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS2-205ENST00000547217 TONSLQ96HA7 1378 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 KIF15Q9NS87 1388 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 ASXL2Q76L83 1435 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
PACS2-205ENST00000547217 PZPP20742 1482 aa25.01■■□□□ 1.59
PACS2-205ENST00000547217 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PACS2-205ENST00000547217 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25■■□□□ 1.59
PACS2-205ENST00000547217 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
PACS2-205ENST00000547217 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.97■■□□□ 1.59
PACS2-205ENST00000547217 NUP155O75694 1391 aa24.96■■□□□ 1.59
PACS2-205ENST00000547217 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.95■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 PKD2Q13563 968 aa24.94■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 ABCC1P33527 1531 aa24.93■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 AFAP1Q8N556 730 aa24.93■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.92■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.91■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.91■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 FANCAO15360 1455 aa24.89■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PACS2-205ENST00000547217 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.88■■□□□ 1.57
PACS2-205ENST00000547217 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.88■■□□□ 1.57
PACS2-205ENST00000547217 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.571e-6■■□□□ 14.1
PACS2-205ENST00000547217 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACS2-205ENST00000547217 MIER1Q8N108 512 aa24.84■■□□□ 1.57
PACS2-205ENST00000547217 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PACS2-205ENST00000547217 PLXNC1O60486 1568 aa24.83■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.8■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.8■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 ADGRL1O94910 1474 aa24.79■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.77■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.77■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 CD109Q6YHK3 1445 aa24.77■■□□□ 1.56
PACS2-205ENST00000547217 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.76■■□□□ 1.55
PACS2-205ENST00000547217 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-205ENST00000547217 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-205ENST00000547217 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-205ENST00000547217 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-205ENST00000547217 ERBINQ96RT1 1412 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-205ENST00000547217 UNC13BO14795 1591 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-205ENST00000547217 ATP7AQ04656 1500 aa24.67■■□□□ 1.54
PACS2-205ENST00000547217 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PACS2-205ENST00000547217 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PACS2-205ENST00000547217 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.63■■□□□ 1.53
PACS2-205ENST00000547217 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PACS2-205ENST00000547217 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PACS2-205ENST00000547217 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.61■■□□□ 1.53
PACS2-205ENST00000547217 KIF3BO15066 747 aa24.6■■□□□ 1.53
PACS2-205ENST00000547217 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.59■■□□□ 1.53
PACS2-205ENST00000547217 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.58■■□□□ 1.53
PACS2-205ENST00000547217 PLA2R1Q13018 1463 aa24.58■■□□□ 1.53
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