RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 UACAQ9BZF9 1416 aa26.94■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.94■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.91■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.9■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 AKNAQ7Z591 1439 aa26.9■■□□□ 1.9
SYTL1-208ENST00000543823 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SYTL1-208ENST00000543823 ABCC2Q92887 1545 aa26.83■■□□□ 1.89
SYTL1-208ENST00000543823 ROCK1Q13464 1354 aa26.81■■□□□ 1.88
SYTL1-208ENST00000543823 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SYTL1-208ENST00000543823 TRIM52Q96A61 297 aa26.78■■□□□ 1.88
SYTL1-208ENST00000543823 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SYTL1-208ENST00000543823 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.75■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.73■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 NCOA1Q15788 1441 aa26.73■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.73■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 TONSLQ96HA7 1378 aa26.72■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 FOXD1Q16676 465 aa26.71■■□□□ 1.87
SYTL1-208ENST00000543823 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.69■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.69■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.68■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 PREX2Q70Z35 1606 aa26.68■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.68■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 ADGRL2O95490 1459 aa26.67■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 KCNH8Q96L42 1107 aa26.65■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.65■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 MBD5Q9P267 1494 aa26.65■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.64■■□□□ 1.86
SYTL1-208ENST00000543823 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SYTL1-208ENST00000543823 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.62■■□□□ 1.85
SYTL1-208ENST00000543823 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.58■■□□□ 1.85
SYTL1-208ENST00000543823 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.57■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 PZPP20742 1482 aa26.57■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.56■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.56■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.55■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.53■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.53■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.51■■□□□ 1.84
SYTL1-208ENST00000543823 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.51■■□□□ 1.83
SYTL1-208ENST00000543823 OSCARQ8IYS5 282 aa26.5■■□□□ 1.83
SYTL1-208ENST00000543823 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.49■■□□□ 1.83
SYTL1-208ENST00000543823 TSPY4P0CV99 314 aa26.49■■□□□ 1.83
SYTL1-208ENST00000543823 TSPY10P0CW01 314 aa26.49■■□□□ 1.83
SYTL1-208ENST00000543823 KIF15Q9NS87 1388 aa26.48■■□□□ 1.83
SYTL1-208ENST00000543823 PLCH2O75038 1416 aa26.45■■□□□ 1.82
SYTL1-208ENST00000543823 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.42■■□□□ 1.82
SYTL1-208ENST00000543823 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.41■■□□□ 1.82
SYTL1-208ENST00000543823 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SYTL1-208ENST00000543823 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.39■■□□□ 1.82
SYTL1-208ENST00000543823 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.38■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 PKD2Q13563 968 aa26.38■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 NUP155O75694 1391 aa26.37■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.36■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.35■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 ABCC1P33527 1531 aa26.35■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.34■■□□□ 1.81
SYTL1-208ENST00000543823 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.33■■□□□ 1.8
SYTL1-208ENST00000543823 ASXL2Q76L83 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
SYTL1-208ENST00000543823 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.31■■□□□ 1.8
SYTL1-208ENST00000543823 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.31■■□□□ 1.8
SYTL1-208ENST00000543823 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.28■■□□□ 1.8
SYTL1-208ENST00000543823 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SYTL1-208ENST00000543823 PLXNC1O60486 1568 aa26.27■■□□□ 1.8
SYTL1-208ENST00000543823 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.25■■□□□ 1.79
SYTL1-208ENST00000543823 AFAP1Q8N556 730 aa26.24■■□□□ 1.79
SYTL1-208ENST00000543823 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.23■■□□□ 1.79
SYTL1-208ENST00000543823 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.23■■□□□ 1.79
SYTL1-208ENST00000543823 FANCAO15360 1455 aa26.2■■□□□ 1.79
SYTL1-208ENST00000543823 UNC13BO14795 1591 aa26.19■■□□□ 1.78
SYTL1-208ENST00000543823 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.783e-9■■■□□ 16.3
SYTL1-208ENST00000543823 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.16■■□□□ 1.78
SYTL1-208ENST00000543823 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.15■■□□□ 1.78
SYTL1-208ENST00000543823 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.15■■□□□ 1.78
SYTL1-208ENST00000543823 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.782e-7■■□□□ 13.7
SYTL1-208ENST00000543823 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 ERBINQ96RT1 1412 aa26.1■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 ADGRL1O94910 1474 aa26.1■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 PLA2R1Q13018 1463 aa26.09■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.09■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.09■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 ANP32CO43423 234 aa26.08■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.08■■□□□ 1.77
SYTL1-208ENST00000543823 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SYTL1-208ENST00000543823 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.05■■□□□ 1.76
SYTL1-208ENST00000543823 ATP7AQ04656 1500 aa26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms